More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2746 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  87.47 
 
 
456 aa  806  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.49221e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  98.89 
 
 
449 aa  911  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  1.5005e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  86.61 
 
 
457 aa  818  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  2.10085e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  87.47 
 
 
456 aa  806  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.42965e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  87.92 
 
 
456 aa  808  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.48025e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  71.53 
 
 
465 aa  652  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  4.22836e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0410  exodeoxyribonuclease VII large subunit  73.32 
 
 
459 aa  634  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.34785e-10  hitchhiker  0.000369784 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  73.93 
 
 
461 aa  691  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  6.45996e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1301  exodeoxyribonuclease VII large subunit  73.54 
 
 
459 aa  637  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  1.14365e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  88.37 
 
 
456 aa  812  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  6.33307e-06  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  86.77 
 
 
455 aa  805  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  4.23152e-09  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  73.36 
 
 
462 aa  663  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  99.33 
 
 
449 aa  914  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  72.69 
 
 
464 aa  659  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
449 aa  920  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  6.99903e-06  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  73.02 
 
 
458 aa  650  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  1.30865e-09  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  99.55 
 
 
449 aa  916  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  99.33 
 
 
449 aa  915  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  9.63372e-05  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  87.47 
 
 
456 aa  806  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.02008e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  87.92 
 
 
456 aa  784  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  3.26312e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  88.37 
 
 
456 aa  812  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1193  exodeoxyribonuclease VII large subunit  73.32 
 
 
458 aa  634  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.10806e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  57.69 
 
 
443 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  57.01 
 
 
443 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  57.21 
 
 
446 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  55.99 
 
 
444 aa  498  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1216  exodeoxyribonuclease VII large subunit  55 
 
 
448 aa  479  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0401789  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1558  exodeoxyribonuclease VII large subunit  52.06 
 
 
442 aa  471  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0686099  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.91 
 
 
445 aa  459  1e-128  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.1 
 
 
446 aa  455  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.6399e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.38 
 
 
442 aa  452  1e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3125  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.23 
 
 
442 aa  451  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284972  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2951  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  50.57 
 
 
447 aa  446  1e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19698  normal  0.152138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4244  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.23 
 
 
444 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  48.42 
 
 
450 aa  440  1e-122  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.07 
 
 
448 aa  438  1e-122  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.95 
 
 
448 aa  439  1e-122  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.3 
 
 
448 aa  439  1e-122  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.85 
 
 
466 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.95 
 
 
448 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.3 
 
 
448 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.73 
 
 
448 aa  438  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.06 
 
 
448 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2360  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.98 
 
 
447 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.203365  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.71 
 
 
445 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3121  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  49.08 
 
 
444 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.64 
 
 
450 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.10023e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.05 
 
 
451 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.19 
 
 
454 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  48.87 
 
 
458 aa  398  1e-110  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.49 
 
 
467 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.34 
 
 
446 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  2.7114e-06  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.89 
 
 
475 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.85 
 
 
458 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1034  Exodeoxyribonuclease VII  48.53 
 
 
447 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.1 
 
 
414 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.65 
 
 
414 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.19 
 
 
448 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.92 
 
 
476 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.92 
 
 
456 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.86 
 
 
453 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.07972e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.06 
 
 
447 aa  366  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.82 
 
 
463 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.37 
 
 
463 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.69 
 
 
451 aa  360  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.03 
 
 
445 aa  358  9e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.92 
 
 
463 aa  358  1e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.63 
 
 
457 aa  356  4e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.64 
 
 
463 aa  355  7e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.78 
 
 
452 aa  355  9e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.78 
 
 
452 aa  355  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.11 
 
 
448 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.1 
 
 
458 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.92 
 
 
459 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.37 
 
 
463 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.37 
 
 
459 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.78 
 
 
452 aa  353  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.78 
 
 
452 aa  353  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.78 
 
 
452 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.78 
 
 
452 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.78 
 
 
452 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.58 
 
 
453 aa  352  8e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.78 
 
 
452 aa  351  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.39 
 
 
458 aa  350  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.55 
 
 
452 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.93 
 
 
454 aa  350  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  1.69842e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.55 
 
 
452 aa  350  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.33 
 
 
446 aa  346  6e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.01941e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.92 
 
 
443 aa  345  1e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0857  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.15 
 
 
443 aa  345  1e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  44.09 
 
 
452 aa  345  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  7.16955e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.05 
 
 
460 aa  338  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2759  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.66 
 
 
443 aa  338  1e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.340088  normal  0.610939 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2462  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.05 
 
 
460 aa  337  2e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1339  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.27 
 
 
462 aa  337  3e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15230  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.27 
 
 
459 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173867  hitchhiker  8.74033e-10 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.82 
 
 
460 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144595  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.95 
 
 
459 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.59 
 
 
459 aa  333  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0516461  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.61 
 
 
448 aa  331  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>