More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2826 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
266 aa  529  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  81.06 
 
 
266 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  80.08 
 
 
266 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  80.08 
 
 
266 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  80.08 
 
 
266 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  80.68 
 
 
266 aa  434  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  80.08 
 
 
266 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  80.3 
 
 
266 aa  434  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  80.3 
 
 
266 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  80.68 
 
 
266 aa  431  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  76.89 
 
 
266 aa  417  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  76.14 
 
 
266 aa  411  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  76.92 
 
 
266 aa  408  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  77.87 
 
 
266 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  73.11 
 
 
266 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  70.08 
 
 
266 aa  381  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  61.51 
 
 
267 aa  325  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.26 
 
 
267 aa  323  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.25 
 
 
267 aa  312  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.45 
 
 
266 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.16 
 
 
267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.23 
 
 
266 aa  301  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.99 
 
 
272 aa  290  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0174  putative undecaprenol kinase  56.7 
 
 
267 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.11 
 
 
265 aa  275  6e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  55.2 
 
 
266 aa  270  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.54 
 
 
265 aa  266  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.78 
 
 
265 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.52 
 
 
266 aa  251  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.42 
 
 
264 aa  243  3e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.53 
 
 
265 aa  241  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.17 
 
 
264 aa  237  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2096  undecaprenyl-diphosphatase  53.56 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.76838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  40.6 
 
 
274 aa  218  8.999999999999998e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  43.56 
 
 
279 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  43.68 
 
 
269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.43 
 
 
282 aa  192  5e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.78 
 
 
276 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1834  Bacitracin resistance protein BacA  40.07 
 
 
265 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  41.47 
 
 
272 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.55 
 
 
292 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0115  bacitracin resistance protein BacA  42.53 
 
 
268 aa  185  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153231  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  36.94 
 
 
386 aa  185  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  39.1 
 
 
285 aa  185  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  40.31 
 
 
272 aa  184  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  42.21 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.55 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.31 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  37.41 
 
 
289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  42.31 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.96 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  38.29 
 
 
277 aa  181  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.06 
 
 
292 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.45 
 
 
276 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  42.53 
 
 
262 aa  178  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.13 
 
 
282 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  39.47 
 
 
272 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.22 
 
 
286 aa  175  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  40.23 
 
 
264 aa  175  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.97 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  39.7 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0247  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.4 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  38.13 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.37 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.37 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  37.97 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  40.38 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.37 
 
 
282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  41.53 
 
 
281 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.18 
 
 
282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  37.27 
 
 
281 aa  172  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  38.49 
 
 
280 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1478  undecaprenol kinase  36.47 
 
 
290 aa  172  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  42.42 
 
 
269 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3593  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.51 
 
 
267 aa  172  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
282 aa  171  9e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.06 
 
 
276 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0708  undecaprenyl-diphosphatase  38.55 
 
 
302 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.35 
 
 
278 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.04 
 
 
282 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2011  undecaprenol kinase  37.04 
 
 
300 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.5 
 
 
280 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  38.4 
 
 
279 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2249  undecaprenol kinase  38.01 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221802  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.05 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0446  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.14 
 
 
294 aa  166  4e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0953446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.4 
 
 
275 aa  164  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.33 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2133  undecaprenol kinase  34.77 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3383  putative undecaprenol kinase  37.69 
 
 
290 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3867  undecaprenol kinase  41.04 
 
 
271 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2821  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.31 
 
 
267 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184257  normal  0.392162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0597  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.7 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0649  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.33 
 
 
270 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0683  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.33 
 
 
270 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0750  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.33 
 
 
270 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0593  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.33 
 
 
270 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0738  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.33 
 
 
270 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6963000000000003e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0594  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.33 
 
 
270 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0810  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.33 
 
 
270 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>