16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0583 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0583  ParB-like nuclease  100 
 
 		 130 aa  270  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000149246  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6955  ParB domain protein nuclease  40.94 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0631  hypothetical protein  39.83 
 
 		 142 aa  95.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8477  ParB domain protein nuclease  32.54 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1604  nuclease  33.6 
 
 		 168 aa  67  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123974  normal  0.579728 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3687  hypothetical protein  33.06 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726318  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3899  hypothetical protein  34.45 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1089  ParB domain protein nuclease  41.27 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.767607  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2111  nuclease  40.28 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1066  nuclease  33.94 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1545  paREP1  30.48 
 
 		 280 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.972627 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1373  paREP1  33.65 
 
 		 278 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0280  paREP1  32.69 
 
 		 273 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.216208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  28.83 
 
 		 293 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  27.93 
 
 		 293 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>