37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1542 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  86.94 
 
 
360 aa  654    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  97.53 
 
 
364 aa  735    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  748    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  97.5 
 
 
360 aa  724    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  34.26 
 
 
338 aa  125  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  30.7 
 
 
337 aa  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000125522  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  28.19 
 
 
340 aa  106  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  29.04 
 
 
323 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  28.61 
 
 
345 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  28.27 
 
 
336 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  28.53 
 
 
345 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  31.39 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  28.28 
 
 
345 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4040  hypothetical protein  29.96 
 
 
342 aa  95.9  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  30.94 
 
 
337 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  31.39 
 
 
337 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  31.39 
 
 
337 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  29.57 
 
 
342 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  29.57 
 
 
342 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  28.62 
 
 
336 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  31.72 
 
 
337 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  31.28 
 
 
337 aa  92.4  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  28.8 
 
 
336 aa  92.8  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  31.28 
 
 
337 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  27.46 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  27.33 
 
 
345 aa  92  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  27.68 
 
 
332 aa  86.3  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  27.41 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  25.41 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  31.72 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  25.19 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  24.73 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  24.33 
 
 
367 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  21.32 
 
 
330 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  25.91 
 
 
318 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  29.01 
 
 
523 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  22.65 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>