17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1083 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1143  Beta-N-acetylhexosaminidase  96.57 
 
 
2799 bp  4779    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000565131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3212  Beta-N-acetylhexosaminidase  96.9 
 
 
2808 bp  4877    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000385036  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1177  Beta-N-acetylhexosaminidase  97.75 
 
 
2799 bp  5041    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0322091  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  88.13 
 
 
2703 bp  1211    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1083    100 
 
 
2798 bp  5547    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000810703  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3115  beta-N-acetylhexosaminidase  85 
 
 
2808 bp  944    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000817538  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  79.8 
 
 
2691 bp  387  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  79.44 
 
 
2691 bp  373  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3018  Beta-N-acetylhexosaminidase  79.1 
 
 
2691 bp  327  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00614959  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  84.88 
 
 
2655 bp  135  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  91.18 
 
 
2721 bp  87.7  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  82.96 
 
 
2667 bp  85.7  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  87.65 
 
 
2667 bp  81.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  81.33 
 
 
2667 bp  75.8  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  93.94 
 
 
2658 bp  50.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  91.89 
 
 
2748 bp  50.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  84.62 
 
 
2646 bp  50.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>