27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1144 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1122  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  208  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1144  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  208  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0791111  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0647  chitinase-related protein  81.9 
 
 
105 aa  175  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  45.45 
 
 
727 aa  65.9  2e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  36.36 
 
 
699 aa  63.5  8e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  46.15 
 
 
2638 aa  61.6  3e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2581  neutral protease  46.15 
 
 
884 aa  61.6  3e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1855e-15 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2393  thermolysin metallopeptidase  46.15 
 
 
530 aa  62  3e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2310  bacillolysin  47.69 
 
 
886 aa  61.2  5e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2571  neutral protease A, bacillolysin  40.51 
 
 
891 aa  61.2  5e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  4.42231e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2348  bacillolysin (neutral protease)  39.24 
 
 
890 aa  59.7  1e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00113983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2534  neutral protease  36.14 
 
 
887 aa  58.2  3e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.596256  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2624  bacillolysin  38.89 
 
 
891 aa  58.5  3e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  6.36329e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  39.73 
 
 
729 aa  57.4  6e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  39.73 
 
 
729 aa  57.4  6e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2789  bacillolysin  55.77 
 
 
893 aa  57  9e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000716183  hitchhiker  1.52737e-07 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  41.67 
 
 
565 aa  56.6  1e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  40.23 
 
 
2142 aa  54.3  5e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0949  chitinase B  51.79 
 
 
64 aa  53.1  1e-06  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00782065  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2383  putative surface protein  40.28 
 
 
929 aa  47.8  5e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  41.51 
 
 
503 aa  47.4  7e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  37.5 
 
 
1465 aa  47  9e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  37.5 
 
 
1687 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06580  predicted xylanase/chitin deacetylase  33.8 
 
 
629 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93602  predicted protein  39.62 
 
 
2146 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00915503 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0209  cell wall anchor domain-containing protein  39.71 
 
 
743 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0210  cell wall anchor domain-containing protein  39.71 
 
 
743 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>