73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0196 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0196  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  343  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0673  hypothetical protein  36.42 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0405  hypothetical protein  37 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0164  protein of unknown function DUF559  37.5 
 
 		 119 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0163  hypothetical protein  33.96 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0037  protein of unknown function DUF559  33.58 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3609  hypothetical protein  34.34 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.239567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2348  hypothetical protein  36.63 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0046  hypothetical protein  34.58 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0647  hypothetical protein  32.04 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.177117 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1705  hypothetical protein  33.05 
 
 		 1421 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1553  hypothetical protein  34.19 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.672305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0952  leucyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 1146 aa  55.8  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2461  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  31.54 
 
 		 1403 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1525  hypothetical protein  33.04 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0562  hypothetical protein  31.37 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0683  hypothetical protein  36.36 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2357  protein of unknown function DUF559  30.36 
 
 		 117 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218447  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1559  hypothetical protein  34.65 
 
 		 121 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01277  hypothetical protein  30.36 
 
 		 117 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2336  hypothetical protein  30.36 
 
 		 117 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3958  hypothetical protein  33.98 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119424  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1496  hypothetical protein  30.36 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.668416  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0550  DNA methyltransferase  35.65 
 
 		 1192 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0608509  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0029  hypothetical protein  38.64 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01266  hypothetical protein  30.36 
 
 		 117 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51690  hypothetical protein  35.29 
 
 		 120 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00189742  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4935  protein of unknown function DUF559  33.01 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0533861  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7441  protein of unknown function DUF559  31.48 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0206411  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3209  protein of unknown function DUF559  27.83 
 
 		 122 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0254559 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0701  hypothetical protein  36.36 
 
 		 116 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2301  hypothetical protein  29.81 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  0.158552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0003  hypothetical protein  31.37 
 
 		 123 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0011  protein of unknown function DUF559  31.68 
 
 		 123 aa  50.8  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1403  hypothetical protein  32.32 
 
 		 148 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0860159  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  32.35 
 
 		 849 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1572  hypothetical protein  32.58 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.62267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0813  protein of unknown function DUF559  34.34 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3525  hypothetical protein  35.16 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.739621  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0541  hypothetical protein  34.74 
 
 		 225 aa  48.5  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.164679  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2534  hypothetical protein  30.39 
 
 		 114 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.984532  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1869  hypothetical protein  30.39 
 
 		 111 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0546  hypothetical protein  36.17 
 
 		 123 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  0.680217 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0022  protein of unknown function DUF559  27.68 
 
 		 123 aa  48.5  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3954  hypothetical protein  35.82 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0732034  normal  0.657782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1188  hypothetical protein  29.57 
 
 		 124 aa  47.8  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3969  hypothetical protein  36.96 
 
 		 126 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897432  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0900  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4529  hypothetical protein  31.73 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3456  hypothetical protein  29.91 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1369  hypothetical protein  27.74 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.628827  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1037  hypothetical protein  38.1 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252748 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1569  hypothetical protein  34.83 
 
 		 123 aa  45.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0914412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  31.37 
 
 		 1279 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0966  hypothetical protein  33.01 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1700  hypothetical protein  34.83 
 
 		 123 aa  45.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.768881  normal  0.131278 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0548  hypothetical protein  35.8 
 
 		 104 aa  45.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.249593  normal  0.197287 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2722  hypothetical protein  31.82 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2211  protein of unknown function DUF559  31.91 
 
 		 122 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2274  protein of unknown function DUF559  31.91 
 
 		 122 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0690835  hitchhiker  0.00000422818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1959  hypothetical protein  32.73 
 
 		 121 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00461889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1094  hypothetical protein  26.92 
 
 		 144 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.090836  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2356  hypothetical protein  29.25 
 
 		 142 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0831458  normal  0.14274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5447  protein of unknown function DUF559  31.07 
 
 		 137 aa  42  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1229  hypothetical protein  32.61 
 
 		 159 aa  42  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1651  hypothetical protein  32.14 
 
 		 123 aa  41.6  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.173926 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1037  protein of unknown function DUF559  28.85 
 
 		 122 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2097  hypothetical protein  29.81 
 
 		 118 aa  41.6  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1774  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  41.2  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0282  hypothetical protein  27.36 
 
 		 122 aa  40.8  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2473  protein of unknown function DUF559  33.33 
 
 		 121 aa  40.8  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3118  protein of unknown function DUF559  33.33 
 
 		 133 aa  40.8  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.000000197105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>