70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3559 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3926  AbgT putative transporter  82.84 
 
 		 535 aa  852    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  74.44 
 
 		 534 aa  742    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  68.46 
 
 		 534 aa  662    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0094  AbgT putative transporter  84.96 
 
 		 511 aa  827    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002729  multidrug efflux pump component MtrF  74.25 
 
 		 528 aa  748    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.189489  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  83.8 
 
 		 537 aa  890    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  100 
 
 		 535 aa  1065    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4247  AbgT putative transporter  82.07 
 
 		 540 aa  849    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4042  AbgT putative transporter  82.65 
 
 		 535 aa  852    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4208  AbgT putative transporter  82.07 
 
 		 540 aa  850    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  71.96 
 
 		 530 aa  738    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03248  hypothetical protein  75.05 
 
 		 522 aa  731    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3833  AbgT putative transporter  82.65 
 
 		 535 aa  851    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  74.47 
 
 		 525 aa  736    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  71.67 
 
 		 532 aa  734    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  84.72 
 
 		 538 aa  845    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  82.37 
 
 		 539 aa  861    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4058  AbgT putative transporter  82.59 
 
 		 539 aa  867    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000746135  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4381  AbgT putative transporter  82.26 
 
 		 540 aa  850    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  82.04 
 
 		 538 aa  856    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  53.23 
 
 		 512 aa  499  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  47.9 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  45.33 
 
 		 518 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0389  hypothetical protein  43.19 
 
 		 519 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0739  putative ion transporter  42.67 
 
 		 519 aa  415  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004283  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  41.64 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  43.21 
 
 		 515 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01141  hypothetical protein  42.61 
 
 		 519 aa  411  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  42 
 
 		 518 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1944  AbgT putative transporter  43.07 
 
 		 519 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432903  decreased coverage  0.00626673 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  39.81 
 
 		 511 aa  400  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  41.54 
 
 		 520 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  40.68 
 
 		 512 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  43.15 
 
 		 529 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  41.49 
 
 		 519 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0160  transporter, putative  42.11 
 
 		 519 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  39.88 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0146  AbgT putative transporter  41.46 
 
 		 519 aa  365  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0151  AbgT putative transporter  41.46 
 
 		 519 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0147  AbgT putative transporter  41.25 
 
 		 519 aa  365  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0146  AbgT putative transporter  42.03 
 
 		 519 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4202  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  39.88 
 
 		 508 aa  362  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.609868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  37.62 
 
 		 512 aa  360  5e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  37.62 
 
 		 512 aa  360  5e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0029  AbgT putative transporter  40.12 
 
 		 506 aa  341  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.8 
 
 		 510 aa  339  9e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.6 
 
 		 510 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328307 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.6 
 
 		 508 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.6 
 
 		 508 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.6 
 
 		 505 aa  336  5e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  37.3 
 
 		 507 aa  336  5e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  38.4 
 
 		 508 aa  336  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  38.4 
 
 		 508 aa  336  7.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  38.4 
 
 		 508 aa  336  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.4 
 
 		 508 aa  336  7.999999999999999e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0167  AbgT putative transporter  34.03 
 
 		 520 aa  325  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.583779  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  39.03 
 
 		 585 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  37.79 
 
 		 523 aa  320  3e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0678  AbgT family protein  37.21 
 
 		 518 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0800  putative efflux pump component MtrF  35.23 
 
 		 509 aa  295  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0748  AbgT putative transporter  37.02 
 
 		 518 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2611  AbgT putative transporter  35.55 
 
 		 552 aa  290  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1579  aminobenzoyl-glutamate transport protein  39.4 
 
 		 305 aa  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  37.5 
 
 		 263 aa  130  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3467  hypothetical protein  47.62 
 
 		 240 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0456304 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01760  hypothetical protein  22.84 
 
 		 500 aa  54.3  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1143  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.4 
 
 		 484 aa  50.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0766  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  23.17 
 
 		 477 aa  47  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.607983  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1891  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  44.26 
 
 		 464 aa  45.4  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2668  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  38.46 
 
 		 460 aa  43.9  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>