177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0170 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0170  protein of unknown function DUF55  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0496  protein of unknown function DUF55  66.67 
 
 		 132 aa  185  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0242  protein of unknown function DUF55  45.9 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0087907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1486  hypothetical protein  44.93 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2489  hypothetical protein  44.17 
 
 		 142 aa  114  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016498  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2368  hypothetical protein  43.33 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.864843  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0082  hypothetical protein  41.98 
 
 		 135 aa  103  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5451  protein of unknown function DUF55  40.91 
 
 		 137 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.794452 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1261  protein of unknown function DUF55  39.1 
 
 		 139 aa  100  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1154  hypothetical protein  40.77 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.306462  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0926  hypothetical protein  39.69 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0724  hypothetical protein  39.23 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.142066  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0705  hypothetical protein  37.69 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0061  hypothetical protein  39.66 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177861  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1217  protein of unknown function DUF55  37.12 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.02485  hitchhiker  0.000132613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1108  hypothetical protein  37.88 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0317  hypothetical protein  37.88 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2222  protein of unknown function DUF55  36.84 
 
 		 147 aa  87.8  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.155182 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0064  protein of unknown function DUF55  37.21 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4077  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2173  hypothetical protein  38.4 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1341  hypothetical protein  38.64 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414601 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1331  hypothetical protein  33.85 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00023234  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0076  protein of unknown function DUF55  37.21 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0468  hypothetical protein  38.84 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0291  hypothetical protein  38.64 
 
 		 137 aa  84.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0059  hypothetical protein  37.21 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3598  hypothetical protein  41.07 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289311  normal  0.0163526 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2937  protein of unknown function DUF55  36.36 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.362763 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2001  hypothetical protein  36.09 
 
 		 141 aa  83.6  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3218  hypothetical protein  37.78 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3412  protein of unknown function DUF55  38.52 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0472  hypothetical protein  37.12 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.904612  normal  0.134048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1136  protein of unknown function DUF55  38.21 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115295  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0742  protein of unknown function DUF55  39.34 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0559  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0729  hypothetical protein  39.34 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.580961 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2850  hypothetical protein  36.72 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1317  hypothetical protein  36.09 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559236  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0044  hypothetical protein  35.61 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2907  hypothetical protein  34.78 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2115  hypothetical protein  31.3 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0254  protein of unknown function DUF55  34.85 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049773  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1357  hypothetical protein  33.77 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000263938  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0702  protein of unknown function DUF55  38.52 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1748  hypothetical protein  37.4 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2832  hypothetical protein  34.33 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16301  hypothetical protein  34.48 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3206  hypothetical protein  37.19 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162762  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2026  hypothetical protein  33.09 
 
 		 189 aa  77  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.661768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2275  hypothetical protein  34.23 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1041  hypothetical protein  36.57 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3142  hypothetical protein  36.91 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0190  protein of unknown function DUF55  36.11 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.450545 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2363  hypothetical protein  34.9 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3573  hypothetical protein  36.15 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  32.89 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0926  protein of unknown function DUF55  35.88 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2948  hypothetical protein  32.19 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5229  hypothetical protein  33.56 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0315  hypothetical protein  32.88 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4260  protein of unknown function DUF55  34.69 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00302  hypothetical protein  35.17 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4320  protein of unknown function DUF55  34.69 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000124301  hitchhiker  0.00573912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5440  hypothetical protein  32.88 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1521  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0365947  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3975  protein of unknown function DUF55  34.9 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.644317  normal  0.0207421 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0697  protein of unknown function DUF55  36.03 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0319  hypothetical protein  31.85 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  35.57 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  35.57 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000393887  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16181  hypothetical protein  33.1 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0353  hypothetical protein  32.67 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2723  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1737  protein of unknown function DUF55  33.33 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000864721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2648  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1891  hypothetical protein  33.87 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1819  hypothetical protein  33.87 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0710947  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  30.92 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0651  hypothetical protein  32.85 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3129  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  31.97 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16061  hypothetical protein  33.79 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0961  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02383  hypothetical protein  32.67 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4026  hypothetical protein  45.83 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69050  hypothetical protein  30.67 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2609  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0843  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1677  hypothetical protein  32.45 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2962  hypothetical protein  33.6 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.481941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0971  hypothetical protein  33.06 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5031  hypothetical protein  29.25 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5266  hypothetical protein  29.73 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3212  hypothetical protein  31.08 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0060  hypothetical protein  33.87 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1853  protein of unknown function DUF55  30.34 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.890211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4432  hypothetical protein  29.93 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.830647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2537  hypothetical protein  34.01 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  0.0651387 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2196  hypothetical protein  30.34 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0953  hypothetical protein  31.72 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>