More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1163 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0941  pyruvate kinase  83.2 
 
 
500 aa  854    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1456  pyruvate kinase  77.89 
 
 
502 aa  805    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.348226  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1163  pyruvate kinase  100 
 
 
500 aa  1011    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0775  pyruvate kinase  49.2 
 
 
473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.153908  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0882  pyruvate kinase  47.31 
 
 
589 aa  451  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.441073  hitchhiker  0.000000000000201084 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0751  pyruvate kinase  47.49 
 
 
473 aa  444  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000115769  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1002  pyruvate kinase  47.08 
 
 
477 aa  440  9.999999999999999e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  44.31 
 
 
588 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  44.71 
 
 
587 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  45.62 
 
 
584 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  44.18 
 
 
585 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  44.29 
 
 
585 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  43.98 
 
 
585 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  44.18 
 
 
585 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  43.98 
 
 
585 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  43.98 
 
 
585 aa  392  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  43.98 
 
 
585 aa  392  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  43.98 
 
 
585 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2744  pyruvate kinase  42.57 
 
 
491 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2441  pyruvate kinase  43.15 
 
 
470 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  43.98 
 
 
585 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  44.18 
 
 
585 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1702  pyruvate kinase  42.74 
 
 
470 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000472586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  43.59 
 
 
585 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  43.17 
 
 
583 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  42.48 
 
 
585 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1491  pyruvate kinase  42.17 
 
 
470 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0197868  hitchhiker  0.00000000000000413859 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1475  pyruvate kinase  42.17 
 
 
470 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.0298859 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2187  pyruvate kinase  42.77 
 
 
470 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545007  hitchhiker  0.000000575338 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1793  pyruvate kinase  42.17 
 
 
470 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000263395  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1511  pyruvate kinase  42.17 
 
 
470 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00345195  hitchhiker  0.00000000277605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1964  pyruvate kinase  42.17 
 
 
470 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000120282  hitchhiker  0.00000000245997 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01645  pyruvate kinase  42.17 
 
 
470 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000322143  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1966  pyruvate kinase  42.17 
 
 
470 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000099684  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2390  pyruvate kinase  42.17 
 
 
470 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000743671  hitchhiker  0.0000173681 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1855  pyruvate kinase  41.77 
 
 
470 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000869854  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2582  pyruvate kinase  41.77 
 
 
470 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00785837  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01635  hypothetical protein  42.17 
 
 
470 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000427708  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1892  pyruvate kinase  42.17 
 
 
470 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1749  pyruvate kinase  41.77 
 
 
470 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.39981e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1768  pyruvate kinase  42.32 
 
 
473 aa  381  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000514797  unclonable  0.00000209228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1757  pyruvate kinase  42.17 
 
 
470 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.18747e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1877  pyruvate kinase  42.17 
 
 
470 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180077  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1955  pyruvate kinase  42.17 
 
 
470 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000401811  unclonable  0.000000014136 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1520  pyruvate kinase  42.17 
 
 
470 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000224591  decreased coverage  0.00000000336273 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  43.14 
 
 
578 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1664  pyruvate kinase  42.02 
 
 
469 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000486614  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00829  pyruvate kinase  42.08 
 
 
470 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001645  pyruvate kinase  42.48 
 
 
470 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000413201  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  42.8 
 
 
585 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  42.8 
 
 
585 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2701  pyruvate kinase  41.68 
 
 
470 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  43.8 
 
 
582 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  41.6 
 
 
585 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  42.86 
 
 
479 aa  371  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0037  pyruvate kinase  40.6 
 
 
470 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  41.77 
 
 
467 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  41.77 
 
 
467 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  40 
 
 
590 aa  361  2e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  40.4 
 
 
580 aa  359  6e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  41.24 
 
 
583 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  39.96 
 
 
471 aa  355  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  40.08 
 
 
582 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  41.39 
 
 
472 aa  353  5e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1716  pyruvate kinase  41.4 
 
 
469 aa  352  7e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  40 
 
 
577 aa  352  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  41.49 
 
 
474 aa  351  2e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  39.69 
 
 
474 aa  350  3e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  40.4 
 
 
583 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  41.11 
 
 
580 aa  347  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  38.97 
 
 
580 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2879  pyruvate kinase  40.04 
 
 
469 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.357906  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  39.56 
 
 
474 aa  340  4e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  39.04 
 
 
586 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  38.1 
 
 
471 aa  339  8e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  38.83 
 
 
605 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  37.35 
 
 
474 aa  334  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1115  pyruvate kinase  40.49 
 
 
490 aa  332  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000141137  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  39.01 
 
 
581 aa  330  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  38.84 
 
 
585 aa  329  6e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  38.57 
 
 
494 aa  327  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  37.02 
 
 
485 aa  326  7e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  37.4 
 
 
483 aa  325  9e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  40 
 
 
487 aa  323  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  36.82 
 
 
485 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0501  pyruvate kinase  38.6 
 
 
481 aa  322  9.999999999999999e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.559295  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  39.36 
 
 
491 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  39.56 
 
 
474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03080  pyruvate kinase, putative  38.22 
 
 
572 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1040  pyruvate kinase  39.43 
 
 
480 aa  320  5e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1114  pyruvate kinase  39.8 
 
 
486 aa  320  5e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.679316  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  38.61 
 
 
597 aa  319  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  39.64 
 
 
474 aa  319  9e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  36.2 
 
 
476 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  38 
 
 
580 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_56445  kinase pyruvate kinase 3  37.02 
 
 
543 aa  318  2e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  38.02 
 
 
596 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  37.47 
 
 
592 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  40.04 
 
 
582 aa  317  4e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  37.62 
 
 
596 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>