67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4489 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4489  acetyltransferase  100 
 
 
154 aa  320  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0355  GCN5-related N-acetyltransferase  70.13 
 
 
189 aa  227  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0237  GCN5-related N-acetyltransferase  69.03 
 
 
155 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0237  GCN5-related N-acetyltransferase  69.03 
 
 
155 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0240  GCN5-related N-acetyltransferase  69.03 
 
 
155 aa  219  8e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0243  GCN5-related N-acetyltransferase  68.39 
 
 
155 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3728  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 
158 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2803  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 
161 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.409775  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0422  acetyltransferase  33.09 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1751  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0561  hypothetical protein  31.41 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0019  GCN5-related N-acetyltransferase  29.56 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210318 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0586  hypothetical protein  31.41 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0017  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0633142  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3833  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0014  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1529  GCN5-related N-acetyltransferase  30.09 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4949  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0125  hypothetical protein  31.29 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1313  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000303256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1379  GCN5-related N-acetyltransferase  25.48 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3279  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3465  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04402  acetyltransferase  28.26 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2090  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537656  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3991  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2290  acetyltransferase  28.35 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.410105  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0760  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416915  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0740  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.036935  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1014  GCN5-related N-acetyltransferase  26.53 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.683731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3703  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0346  GCN5-related N-acetyltransferase  23.68 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2837  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0252729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2533  GCN5-related N-acetyltransferase  24.26 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615526  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2279  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
163 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.607238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2349  hypothetical protein  31.03 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587033  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3333  hypothetical protein  22.3 
 
 
175 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.673075  hitchhiker  0.00810135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3516  histone acetyltransferase HPA2/related acetyltransferase  36.49 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2311  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
164 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02800  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  35.09 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0111  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1523  GCN5-related N-acetyltransferase  37.29 
 
 
144 aa  43.9  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.202998  normal  0.0804115 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1391  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.13219  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02488  hypothetical protein  22.7 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1367  acetyltransferase, GNAT family  35 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.027208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1105  GCN5-related N-acetyltransferase  22 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1113  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003043  acetyltransferase GNAT family  29.79 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
314 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00351  acetyltransferase, gnat family  33.78 
 
 
147 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
149 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.70045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
305 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0845  GCN5-related N-acetyltransferase  27.47 
 
 
147 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.084363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  39.34 
 
 
305 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1231  putative acetyltransferase, GNAT family  37.5 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0417  GCN5-related N-acetyltransferase  40.98 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000337844  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4764  GCN5-related N-acetyltransferase  27.47 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0759  acetyltransferase  26.76 
 
 
209 aa  41.2  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00011479  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0894  GCN5-related N-acetyltransferase  38.18 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.250952  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22360  GCN5-related N-acetyltransferase protein  34.62 
 
 
148 aa  41.2  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05651  putative acetyltransferase  28.95 
 
 
182 aa  41.2  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0235  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2061  acetyltransferase  31.18 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450214  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4290  GCN5-related N-acetyltransferase  28.41 
 
 
190 aa  40.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2252  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 
476 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000906633  unclonable  0.000000183294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>