42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2533 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2533  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
151 aa  317  5e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615526  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2837  GCN5-related N-acetyltransferase  89.4 
 
 
156 aa  286  7e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0252729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3703  GCN5-related N-acetyltransferase  65.33 
 
 
150 aa  217  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2290  acetyltransferase  51.02 
 
 
152 aa  174  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.410105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3991  GCN5-related N-acetyltransferase  48 
 
 
152 aa  155  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3833  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
151 aa  90.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3465  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146731  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3279  GCN5-related N-acetyltransferase  43.82 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0740  GCN5-related N-acetyltransferase  29.08 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.036935  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0760  GCN5-related N-acetyltransferase  27.15 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416915  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0355  GCN5-related N-acetyltransferase  24.63 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3728  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0237  GCN5-related N-acetyltransferase  20.9 
 
 
155 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0240  GCN5-related N-acetyltransferase  20.9 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0237  GCN5-related N-acetyltransferase  20.9 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4489  acetyltransferase  24.26 
 
 
154 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0243  GCN5-related N-acetyltransferase  22.96 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1014  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
153 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.683731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2090  GCN5-related N-acetyltransferase  29.84 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537656  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4949  GCN5-related N-acetyltransferase  33.01 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  30.4 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0561  hypothetical protein  27.42 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0586  hypothetical protein  27.42 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04402  acetyltransferase  25.18 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2803  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.409775  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02800  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  31.65 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0422  acetyltransferase  27.87 
 
 
163 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0981  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
161 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0014  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2325  acetyltransferase  29.35 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000933187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1928  GCN5-related N-acetyltransferase  24.14 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1064  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141441  normal  0.157101 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1313  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000303256  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1105  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0626  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0999  acetyltransferase  29.79 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0121067  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0985  GCN5-related N-acetyltransferase  33.66 
 
 
161 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.622918 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0263  GCN5-related N-acetyltransferase  26.26 
 
 
184 aa  41.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.56 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0989  acetyltransferase  26.89 
 
 
166 aa  40.4  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137577  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2349  hypothetical protein  40.48 
 
 
100 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587033  normal  0.249827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>