45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3465 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3465  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
155 aa  319  8e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  89.93 
 
 
150 aa  279  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3833  GCN5-related N-acetyltransferase  71.81 
 
 
151 aa  229  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0740  GCN5-related N-acetyltransferase  68.87 
 
 
164 aa  219  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.036935  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0760  GCN5-related N-acetyltransferase  69.13 
 
 
156 aa  218  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416915  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3279  GCN5-related N-acetyltransferase  54.36 
 
 
158 aa  174  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3991  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
152 aa  85.5  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2837  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0252729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3703  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0355  GCN5-related N-acetyltransferase  32.85 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2533  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615526  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2290  acetyltransferase  30.6 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.410105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0237  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0237  GCN5-related N-acetyltransferase  31.39 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0240  GCN5-related N-acetyltransferase  31.39 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0243  GCN5-related N-acetyltransferase  31.39 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4489  acetyltransferase  28.38 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0422  acetyltransferase  29.79 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4949  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3728  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0586  hypothetical protein  38.95 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2090  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537656  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0561  hypothetical protein  37.89 
 
 
155 aa  60.5  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0125  hypothetical protein  36.67 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04402  acetyltransferase  27.81 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1014  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.683731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2803  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
161 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.409775  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2279  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.607238 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3333  hypothetical protein  25.66 
 
 
175 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.673075  hitchhiker  0.00810135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  27.56 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1313  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000303256  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0014  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4836  GCN5-related N-acetyltransferase  33.07 
 
 
197 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1379  GCN5-related N-acetyltransferase  23.89 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0019  GCN5-related N-acetyltransferase  24.82 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210318 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0771  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  29.66 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2927  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
310 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 
277 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2502  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 
915 aa  41.2  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0826  putative acetyltransferase  36.78 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1529  GCN5-related N-acetyltransferase  24.58 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0017  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 
162 aa  40.8  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0633142  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003177  acetyltransferase  24.14 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2716  GCN5-related N-acetyltransferase  30.33 
 
 
193 aa  40.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>