42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3333 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3333  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  363  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.673075  hitchhiker  0.00810135 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0240  GCN5-related N-acetyltransferase  26.63 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0237  GCN5-related N-acetyltransferase  26.04 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0237  GCN5-related N-acetyltransferase  26.04 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0243  GCN5-related N-acetyltransferase  26.04 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0355  GCN5-related N-acetyltransferase  24.42 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0740  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.036935  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0017  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0633142  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0561  hypothetical protein  27.06 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0019  GCN5-related N-acetyltransferase  25.43 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210318 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0586  hypothetical protein  26.47 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4949  GCN5-related N-acetyltransferase  25.81 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0014  GCN5-related N-acetyltransferase  23.93 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1313  GCN5-related N-acetyltransferase  26.05 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000303256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0760  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416915  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0125  hypothetical protein  28.85 
 
 		 154 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0422  acetyltransferase  26 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2803  GCN5-related N-acetyltransferase  27.04 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.409775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0346  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 172 aa  48.5  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3833  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4489  acetyltransferase  22.3 
 
 		 154 aa  48.1  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3465  GCN5-related N-acetyltransferase  25.66 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  33.02 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146731  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3984  GCN5-like N-acetyltransferase  28.95 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1199  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 		 332 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736196  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04402  acetyltransferase  23.64 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2279  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.607238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1379  GCN5-related N-acetyltransferase  23.33 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33160  acetyltransferase (GNAT) family protein  29.47 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0204184  normal  0.66835 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2820  acetyltransferase, gnat family  26.97 
 
 		 186 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 		 165 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4093  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  36.51 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0453046 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2565  putative acetyltransferase protein  30.77 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5496  GCN5-related N-acetyltransferase  27.69 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334884  normal  0.121728 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  31.94 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2754  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 126 aa  40.8  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0911398  normal  0.0205687 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 		 162 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0159  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 		 162 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0205255  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3326  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 		 166 aa  40.8  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>