37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2279 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2279  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
163 aa  330  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.607238 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0355  GCN5-related N-acetyltransferase  25.77 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0240  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0243  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0237  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0740  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.036935  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0237  GCN5-related N-acetyltransferase  27.55 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0125  hypothetical protein  29.5 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3728  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
158 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3279  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0586  hypothetical protein  29.2 
 
 
155 aa  58.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0760  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416915  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 
150 aa  57.4  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146731  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2803  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.409775  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4489  acetyltransferase  28.12 
 
 
154 aa  55.1  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0561  hypothetical protein  28.18 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0422  acetyltransferase  31.09 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3465  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  26.19 
 
 
152 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1313  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000303256  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3991  GCN5-related N-acetyltransferase  22.69 
 
 
152 aa  51.2  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04402  acetyltransferase  31.11 
 
 
158 aa  50.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3833  GCN5-related N-acetyltransferase  30.85 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4949  GCN5-related N-acetyltransferase  23.31 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1751  GCN5-related N-acetyltransferase  22 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0014  GCN5-related N-acetyltransferase  23.68 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2533  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 
151 aa  43.9  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615526  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3333  hypothetical protein  27.73 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.673075  hitchhiker  0.00810135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2837  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0252729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0019  GCN5-related N-acetyltransferase  21.93 
 
 
160 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2090  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537656  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0017  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
162 aa  42  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0633142  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3703  GCN5-related N-acetyltransferase  24.74 
 
 
150 aa  41.2  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1529  GCN5-related N-acetyltransferase  19.49 
 
 
129 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5241  GCN5-related N-acetyltransferase  33.85 
 
 
255 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0587576  normal  0.726719 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20240  acetyltransferase (GNAT) family protein  26.98 
 
 
244 aa  40.4  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.147961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1379  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
153 aa  40.4  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>