More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2586 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  481  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  89.83 
 
 		 236 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  90.68 
 
 		 236 aa  441  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  89.83 
 
 		 236 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  83.97 
 
 		 237 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  84.39 
 
 		 237 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  84.39 
 
 		 237 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  84.39 
 
 		 237 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  82.63 
 
 		 236 aa  401  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  72.46 
 
 		 234 aa  348  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  70.93 
 
 		 233 aa  332  4e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  68.56 
 
 		 238 aa  316  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  63.2 
 
 		 239 aa  315  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  64.58 
 
 		 247 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  62.77 
 
 		 239 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  62.71 
 
 		 236 aa  297  9e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  50.43 
 
 		 234 aa  221  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  49.14 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  47.84 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  48.28 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  50.62 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  48.71 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  48.28 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  48.5 
 
 		 233 aa  203  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  46.72 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  46.72 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  46.72 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  48.5 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  46.72 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  46.72 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  47.6 
 
 		 231 aa  201  9e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  46.98 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  47.62 
 
 		 232 aa  198  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  47.62 
 
 		 232 aa  198  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  47.62 
 
 		 232 aa  198  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  46.72 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  46.72 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  46.72 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  46.72 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  46.72 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  46.72 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  46.72 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  46.29 
 
 		 231 aa  194  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  44.73 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  46.29 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  46.81 
 
 		 236 aa  191  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  47.72 
 
 		 238 aa  189  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  44.39 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  45.05 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  46.35 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  44.25 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  44.59 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  44.14 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  43.42 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  43.61 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  43.61 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  43.16 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2231  peptidase M22, glycoprotease  41.13 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391268  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39270  Peptidase M22, glycoprotease  41.96 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  42.67 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  43.3 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  42.04 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  40.62 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  42.37 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  41.36 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1410  peptidase M22 glycoprotease  40.19 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1731  peptidase M22, glycoprotease  39.73 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.978366  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  39.83 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  40.27 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1458  non-proteolytic protein, peptidase family M22  38.46 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1527  M22 peptidase homolog yeaZ  38.46 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  41.81 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  40.43 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  38.84 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  38.39 
 
 		 223 aa  134  9e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  42.53 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1193  peptidase M22, glycoprotease  42.15 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0872  hypothetical protein  38.18 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000381298  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0784  peptidase M22 glycoprotease  39.09 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318216  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  34.93 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  40 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1268  peptidase M22, glycoprotease  33.94 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0540  peptidase M22, glycoprotease  34.73 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714565  unclonable  0.00000000126844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  40 
 
 		 222 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  40 
 
 		 222 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2210  hypothetical protein  37.77 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1984  peptidase M22, glycoprotease  33.91 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5085  peptidase M22 glycoprotease  35.14 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0370  peptidase M22 glycoprotease  45.21 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347647 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1706  metal (zinc) dependent glycoprotease  33.48 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0175811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1981  peptidase M22, glycoprotease  37.44 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.637689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1654  peptidase M22, glycoprotease  34.98 
 
 		 267 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786528  decreased coverage  0.00849888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1240  peptidase M22 glycoprotease  34.08 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2483  peptidase M22 glycoprotease  42.47 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.318654  hitchhiker  0.00075041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2001  glycoprotease family protein  33.88 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1365  peptidase M22 glycoprotease  32.35 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3940  peptidase M22, glycoprotease  34.22 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1306  peptidase M22 glycoprotease  34.22 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0447372  normal  0.269549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1367  putative transmembrane protein  34.53 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.742517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2465  glycoprotease family protein  33.88 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>