More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0540 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0540  peptidase M22, glycoprotease  100 
 
 
230 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714565  unclonable  0.00000000126844 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1984  peptidase M22, glycoprotease  64.07 
 
 
227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015709  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1706  metal (zinc) dependent glycoprotease  64.07 
 
 
227 aa  271  8.000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0175811  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  38.03 
 
 
237 aa  143  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  36.8 
 
 
233 aa  138  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  38.3 
 
 
231 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  38.3 
 
 
231 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  38.3 
 
 
231 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  38.3 
 
 
231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  38.05 
 
 
226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  38.3 
 
 
231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  35.81 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  35.59 
 
 
231 aa  132  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  34.85 
 
 
231 aa  131  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  35.42 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  35.42 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  36.96 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  35.42 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  35.42 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  35.42 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  35.42 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  38.29 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  35 
 
 
231 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  34.31 
 
 
239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  34.91 
 
 
231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  34.5 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  37.77 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  34.89 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  35.12 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  35.98 
 
 
239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  35.9 
 
 
236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  36.75 
 
 
233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  37.61 
 
 
224 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  33.89 
 
 
232 aa  124  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  33.89 
 
 
232 aa  124  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  33.89 
 
 
232 aa  124  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  36.02 
 
 
239 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  36.8 
 
 
224 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  34.89 
 
 
233 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  32.9 
 
 
233 aa  123  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  35.17 
 
 
236 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  36.8 
 
 
224 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  36.32 
 
 
238 aa  122  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  46.15 
 
 
237 aa  122  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  36.36 
 
 
224 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  35.17 
 
 
236 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  35.59 
 
 
236 aa  121  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  36.13 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  32.23 
 
 
238 aa  121  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  36.13 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  35.71 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  35.71 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  37.16 
 
 
224 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  34.04 
 
 
233 aa  118  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  32.47 
 
 
235 aa  118  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  32.34 
 
 
233 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  36.09 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  34.73 
 
 
236 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  35.75 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  37.61 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  35.71 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  34.65 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39270  Peptidase M22, glycoprotease  36.61 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1193  peptidase M22, glycoprotease  35.56 
 
 
229 aa  108  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1410  peptidase M22 glycoprotease  42.97 
 
 
266 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2084  glycoprotease family protein  32.24 
 
 
249 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3228  glycoprotease family protein  32.24 
 
 
249 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1357  glycoprotease family protein  32.24 
 
 
249 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0779357  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  30.34 
 
 
232 aa  104  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2521  glycoprotease family protein  31.84 
 
 
249 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2465  glycoprotease family protein  31.84 
 
 
249 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1731  peptidase M22, glycoprotease  31.17 
 
 
220 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.978366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1582  glycoprotease family protein  31.84 
 
 
256 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2610  glycoprotease family protein  31.43 
 
 
256 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  35.42 
 
 
228 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1654  peptidase M22, glycoprotease  31.84 
 
 
267 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786528  decreased coverage  0.00849888 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2001  glycoprotease family protein  30.49 
 
 
252 aa  99.4  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274689  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1527  M22 peptidase homolog yeaZ  30.18 
 
 
226 aa  98.2  9e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306852  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  30.77 
 
 
237 aa  98.2  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1458  non-proteolytic protein, peptidase family M22  30.18 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2231  peptidase M22, glycoprotease  35.89 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391268  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  28.99 
 
 
223 aa  95.1  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1365  peptidase M22 glycoprotease  29.72 
 
 
279 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  32.06 
 
 
241 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  41.22 
 
 
236 aa  93.2  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2483  peptidase M22 glycoprotease  32.51 
 
 
276 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.318654  hitchhiker  0.00075041 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2210  hypothetical protein  31.05 
 
 
188 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5085  peptidase M22 glycoprotease  30.04 
 
 
239 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1395  peptidase M22, glycoprotease  29.22 
 
 
281 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.834993 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  32.44 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1981  peptidase M22, glycoprotease  29.61 
 
 
229 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.637689 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  32.89 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0976  peptidase M22 glycoprotease  33.85 
 
 
283 aa  88.6  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  32.07 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  28.33 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1240  peptidase M22 glycoprotease  29.79 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  28.02 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0370  peptidase M22 glycoprotease  36.72 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1939  peptidase M22, glycoprotease  29.17 
 
 
282 aa  85.9  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  24.28 
 
 
236 aa  85.5  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>