33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2793 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2793  appr-1-p processing enzyme family protein  100 
 
 
274 aa  577  1e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  90.6 
 
 
293 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4137  Appr-1-p processing domain-containing protein  34.76 
 
 
195 aa  123  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0008  appr-1-p processing domain-containing protein  36.68 
 
 
209 aa  120  2e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00352101  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3377  Appr-1-p processing domain protein  35.78 
 
 
222 aa  113  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.590192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0143  appr-1-p processing domain-containing protein  35.57 
 
 
210 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6708  Appr-1-p processing domain protein  35.93 
 
 
199 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1996  appr-1-p processing domain-containing protein  32.34 
 
 
192 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01180  predicted phosphatase, C-terminal domain of histone macro H2A1 like protein  38.13 
 
 
188 aa  86.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.994546  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0560  Appr-1-p processing domain protein  32.52 
 
 
172 aa  85.1  1e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0273  phosphatase like to the domain of histone macroH2A1  34.29 
 
 
224 aa  78.2  1e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06361  conserved hypothetical protein  30.67 
 
 
249 aa  68.9  8e-11  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.84373  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0099  Appr-1-p processing domain protein  35 
 
 
199 aa  67.8  2e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.310207  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0052  Appr-1-p processing domain protein  30.88 
 
 
159 aa  50.8  2e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1101  hypothetical protein  30.3 
 
 
220 aa  49.7  6e-05  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  28.57 
 
 
174 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  2.78371e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0075  appr-1-p processing domain-containing protein  28.74 
 
 
182 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1293  hypothetical protein  30.94 
 
 
187 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0201116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  29.75 
 
 
170 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0073  Appr-1-p processing domain protein  31.78 
 
 
175 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00241191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  27.46 
 
 
162 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0257  hypothetical protein  32.5 
 
 
196 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.588012  normal  0.197055 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  27.82 
 
 
177 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0869  Appr-1-p processing domain protein  28.33 
 
 
190 aa  45.8  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.09005e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1243  hypothetical protein  30.51 
 
 
178 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188062  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0695  Appr-1-p processing domain protein  28.99 
 
 
177 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.701989  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0206  hypothetical protein  29.85 
 
 
178 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2235  Appr-1-p processing domain protein  31.93 
 
 
185 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00772619  hitchhiker  2.96103e-06 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  27.61 
 
 
173 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4619  Appr-1-p processing domain-containing protein  30.38 
 
 
224 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672354  hitchhiker  0.00245683 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16260  hypothetical protein  31.34 
 
 
175 aa  42.7  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0909717  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61741  predicted protein  22 
 
 
285 aa  42.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.116623 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  29.93 
 
 
599 aa  42  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>