More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2389 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 402 aa  805    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  55.3 
 
 		 396 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  55.33 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  55.33 
 
 		 393 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  55.33 
 
 		 393 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 		 393 aa  428  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  54.68 
 
 		 394 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  54.68 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2706  acetyl-CoA acetyltransferases  56.35 
 
 		 394 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.21761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  53.81 
 
 		 396 aa  431  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  55.08 
 
 		 393 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  54.57 
 
 		 392 aa  425  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  56.17 
 
 		 396 aa  425  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  55.7 
 
 		 394 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  53.69 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 		 392 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  53.3 
 
 		 394 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  54.94 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  55.19 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 		 393 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  52.28 
 
 		 392 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  51.27 
 
 		 392 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  55.44 
 
 		 394 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  54.43 
 
 		 394 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  54.43 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  53.05 
 
 		 392 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  54.43 
 
 		 394 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  54.43 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  54.43 
 
 		 394 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  53.3 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  54.18 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  54.82 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  52.54 
 
 		 395 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1953  acetyl-CoA acetyltransferase  54.85 
 
 		 395 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0102019  normal  0.550682 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  53.81 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  54.43 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  53.81 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  53.69 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  53.18 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  52.67 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  53.18 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  53.67 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  55.33 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  53.18 
 
 		 393 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  53.55 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  52.42 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  52.79 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  52.28 
 
 		 392 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  52.93 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  52.93 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  52.93 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  52.93 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1685  acetyl-CoA acetyltransferases  52.28 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813003  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  52.67 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  53.92 
 
 		 394 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  52.93 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  53.18 
 
 		 392 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  56.14 
 
 		 396 aa  408  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  55.19 
 
 		 395 aa  408  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  52.93 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  54.68 
 
 		 395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  53.42 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  54.66 
 
 		 396 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  53.92 
 
 		 394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1134  acetyl-CoA acetyltransferase  51.78 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  55.44 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  54.18 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  55.19 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  55.19 
 
 		 409 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  55.19 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  55.19 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  55.19 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  55.19 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  53.16 
 
 		 393 aa  403  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  54.18 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  53.42 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  51.27 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  52.15 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  55.05 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  53.69 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3058  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  52.16 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  53.69 
 
 		 393 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0032  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 394 aa  393  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.713781  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  52.91 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>