More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0168 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  100 
 
 		 453 aa  924    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  46.44 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  47.75 
 
 		 450 aa  365  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  43.49 
 
 		 444 aa  350  3e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  43.57 
 
 		 435 aa  346  4e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  40.09 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  35.89 
 
 		 455 aa  265  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  34.77 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  34.46 
 
 		 475 aa  249  5e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  34.38 
 
 		 470 aa  247  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  33.93 
 
 		 476 aa  247  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  34.61 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  34.16 
 
 		 476 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  34.3 
 
 		 476 aa  241  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  33.64 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  33.41 
 
 		 473 aa  237  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  33.78 
 
 		 475 aa  236  4e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  32.79 
 
 		 470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  33.56 
 
 		 480 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  32.65 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  33.71 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  33.11 
 
 		 470 aa  229  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  33.56 
 
 		 482 aa  229  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  36.21 
 
 		 437 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  33.56 
 
 		 470 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  33.72 
 
 		 488 aa  226  5.0000000000000005e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  33.33 
 
 		 487 aa  226  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  32.88 
 
 		 479 aa  226  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  33.1 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  33.11 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  33.71 
 
 		 477 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  32.65 
 
 		 481 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  32.65 
 
 		 487 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  32.65 
 
 		 487 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  32.65 
 
 		 470 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  32.65 
 
 		 487 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  32.48 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  34.12 
 
 		 420 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  33.03 
 
 		 485 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  32.43 
 
 		 487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  33.8 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  32.2 
 
 		 470 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  32.19 
 
 		 472 aa  221  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  32.2 
 
 		 479 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  31.97 
 
 		 485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  32.88 
 
 		 472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  31.75 
 
 		 470 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  32.2 
 
 		 481 aa  220  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  32.27 
 
 		 470 aa  220  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  31.97 
 
 		 485 aa  220  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  31.9 
 
 		 483 aa  219  7e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  32.3 
 
 		 405 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  32.96 
 
 		 466 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  32.43 
 
 		 475 aa  219  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  30.91 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  31.97 
 
 		 499 aa  218  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  32.22 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  31.38 
 
 		 465 aa  217  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  29.62 
 
 		 463 aa  216  5e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  32.05 
 
 		 490 aa  216  5.9999999999999996e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  31.15 
 
 		 465 aa  216  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  31.15 
 
 		 465 aa  216  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  32.15 
 
 		 439 aa  216  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  31.97 
 
 		 479 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  31.14 
 
 		 472 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  30.75 
 
 		 471 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  30.91 
 
 		 465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  31.28 
 
 		 472 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  30.91 
 
 		 465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  30.91 
 
 		 465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  30.91 
 
 		 465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  30.91 
 
 		 465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  30.91 
 
 		 463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  32.35 
 
 		 470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  30.68 
 
 		 465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  30.98 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  32.54 
 
 		 440 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  31.07 
 
 		 476 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  31.82 
 
 		 470 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  30.84 
 
 		 477 aa  213  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  31.66 
 
 		 469 aa  213  7e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  32.33 
 
 		 436 aa  213  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  31.29 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  31.75 
 
 		 469 aa  212  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  32.33 
 
 		 465 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  33.41 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  29.74 
 
 		 465 aa  210  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  29.74 
 
 		 465 aa  210  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  30.44 
 
 		 465 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  31.52 
 
 		 481 aa  211  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  30.84 
 
 		 476 aa  210  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  31.89 
 
 		 470 aa  210  4e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  32.05 
 
 		 482 aa  210  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  33.33 
 
 		 478 aa  210  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  31.9 
 
 		 470 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  33.72 
 
 		 439 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  31.63 
 
 		 465 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  33.72 
 
 		 437 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  30.75 
 
 		 471 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  31.17 
 
 		 468 aa  207  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>