More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0105 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  100 
 
 
322 aa  654  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  71.2 
 
 
317 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  67.31 
 
 
324 aa  439  1e-122  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  65.37 
 
 
320 aa  431  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  62.78 
 
 
334 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  63.64 
 
 
325 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  63.64 
 
 
325 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  67.42 
 
 
330 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  64.29 
 
 
323 aa  415  1e-115  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  62.66 
 
 
323 aa  416  1e-115  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1448  quinolinate synthetase  64.29 
 
 
320 aa  411  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  59.55 
 
 
332 aa  403  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  62.66 
 
 
322 aa  400  1e-110  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  60.6 
 
 
333 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  59.93 
 
 
310 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  56.82 
 
 
328 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  56.17 
 
 
328 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  59.25 
 
 
348 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  57.65 
 
 
310 aa  381  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  58.79 
 
 
329 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  58.33 
 
 
332 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  58.58 
 
 
338 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.92 
 
 
331 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  55.41 
 
 
312 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  54.66 
 
 
329 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  54.72 
 
 
310 aa  364  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  54.58 
 
 
304 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  54.07 
 
 
304 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  55.13 
 
 
314 aa  358  5e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0015  quinolinate synthetase  54.66 
 
 
313 aa  358  5e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  53.75 
 
 
304 aa  358  8e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  56.49 
 
 
318 aa  356  4e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  55.05 
 
 
311 aa  356  4e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  53.54 
 
 
304 aa  354  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0868  quinolinate synthetase  52.9 
 
 
324 aa  343  3e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  53.25 
 
 
323 aa  340  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2150  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.72 
 
 
311 aa  333  3e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.484842  normal  0.0905755 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0969  quinolinate synthetase  51.8 
 
 
315 aa  332  7e-90  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.814185  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  49.37 
 
 
319 aa  331  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  51.79 
 
 
322 aa  330  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  50.78 
 
 
321 aa  330  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  47.71 
 
 
307 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1159  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.22 
 
 
341 aa  296  3e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.84 
 
 
324 aa  295  8e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.38 
 
 
298 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  51.31 
 
 
307 aa  294  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0600  quinolinate synthetase  47.15 
 
 
379 aa  293  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.287851  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1740  quinolinate synthetase  46.37 
 
 
352 aa  292  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  51.14 
 
 
303 aa  289  5e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1712  quinolinate synthetase  46.13 
 
 
355 aa  289  5e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0567053 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1901  quinolinate synthetase  44.41 
 
 
349 aa  289  5e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.115299  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0632  quinolinate synthetase  46.13 
 
 
379 aa  287  1e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1888  quinolinate synthetase  44.58 
 
 
360 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683594  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1938  quinolinate synthetase  45.85 
 
 
355 aa  286  3e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43657  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2342  quinolinate synthetase  44.58 
 
 
357 aa  286  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2152  quinolinate synthetase  44.58 
 
 
355 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  7.18643e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2449  quinolinate synthetase  47.4 
 
 
382 aa  286  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  44.52 
 
 
301 aa  286  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2219  quinolinate synthetase  44.58 
 
 
355 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  7.09559e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4505  quinolinate synthetase  44.58 
 
 
355 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.84 
 
 
301 aa  286  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1789  quinolinate synthetase  44.92 
 
 
355 aa  285  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1426  quinolinate synthetase  45.02 
 
 
353 aa  285  6e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00168698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  44.52 
 
 
301 aa  285  7e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1964  quinolinate synthetase  44.72 
 
 
395 aa  284  1e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51330  quinolinate synthetase  47.49 
 
 
352 aa  285  1e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  7.17846e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1950  quinolinate synthetase  44.89 
 
 
357 aa  284  1e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.692849  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0891  quinolinate synthetase  44.73 
 
 
358 aa  284  1e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000130385  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1231  quinolinate synthetase  46.49 
 
 
352 aa  283  2e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.687008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1260  quinolinate synthetase  46.49 
 
 
352 aa  283  2e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720292  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2025  quinolinate synthetase  44.89 
 
 
357 aa  283  2e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00330504  hitchhiker  1.27586e-05 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  48.38 
 
 
331 aa  283  2e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2327  quinolinate synthetase  45.48 
 
 
382 aa  283  2e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0615138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2128  quinolinate synthetase  44.89 
 
 
357 aa  283  3e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252809  hitchhiker  0.00117458 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  47.56 
 
 
303 aa  283  4e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  45.95 
 
 
304 aa  283  4e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3981  quinolinate synthetase  46.49 
 
 
352 aa  283  4e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2232  quinolinate synthetase  44.27 
 
 
355 aa  282  5e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011888  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2202  quinolinate synthetase  44.27 
 
 
360 aa  282  5e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0931792  normal  0.199865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2197  quinolinate synthetase  47.65 
 
 
348 aa  282  5e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293101  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4393  quinolinate synthetase  47.83 
 
 
352 aa  282  6e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0793  quinolinate synthetase  43.65 
 
 
352 aa  281  8e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0774972  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003910  quinolinate synthetase  43.79 
 
 
353 aa  281  8e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4187  quinolinate synthetase  46.49 
 
 
352 aa  281  9e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152766  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01614  quinolinate synthetase  43.79 
 
 
353 aa  281  9e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  46.3 
 
 
308 aa  281  9e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2717  quinolinate synthetase  45.17 
 
 
382 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  47 
 
 
308 aa  279  4e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0026  quinolinate synthetase  46.28 
 
 
370 aa  278  6e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44147  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.63 
 
 
323 aa  278  7e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  8.30693e-06  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1554  quinolinate synthetase  47.21 
 
 
371 aa  278  8e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1696  quinolinate synthetase  44.51 
 
 
353 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2243  quinolinate synthetase  44.55 
 
 
355 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0903  quinolinate synthetase  46.28 
 
 
377 aa  277  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  48.57 
 
 
326 aa  276  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0730  quinolinate synthetase  42.72 
 
 
353 aa  276  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274788  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1895  quinolinate synthetase  46.64 
 
 
378 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0768  quinolinate synthetase  44.37 
 
 
375 aa  275  5e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.68917 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2506  quinolinate synthetase  46.64 
 
 
378 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35390  quinolinate synthetase  47.16 
 
 
352 aa  275  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>