15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2077 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2077  Lipocalin family protein  100 
 
 		 166 aa  323  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00774456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0421  hypothetical protein  98.19 
 
 		 166 aa  318  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2345  Lipocalin family protein  85.52 
 
 		 167 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.039817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3826  Lipocalin-like  40.24 
 
 		 198 aa  98.2  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0515  Lipocalin family protein  34.97 
 
 		 172 aa  70.5  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.10388 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2248  Lipocalin family protein  32.17 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.385259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0595  hypothetical protein  31.47 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  30.59 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  26.44 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  26.44 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  37.5 
 
 		 368 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  39.13 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  25.29 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  25.87 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  29.24 
 
 		 182 aa  42  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>