180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3931 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3931  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal  0.760126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2496  siderophore-interacting protein  43.21 
 
 
333 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4240  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  45.64 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0728  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  37.76 
 
 
345 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.198536  normal  0.463503 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6722  Siderophore-interacting protein  36.46 
 
 
349 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550685  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0118  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  36.71 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3413  siderophore-interacting protein  35.27 
 
 
345 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185243  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3678  siderophore-interacting protein  34.91 
 
 
345 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  32.57 
 
 
366 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  36.3 
 
 
361 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  36.54 
 
 
304 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4656  Siderophore-interacting protein  36.36 
 
 
261 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  32.24 
 
 
270 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  30.4 
 
 
291 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2919  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.88 
 
 
272 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  30.92 
 
 
281 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  32.66 
 
 
275 aa  86.3  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  35.45 
 
 
312 aa  85.9  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  32.11 
 
 
273 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  34.29 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.38 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  30.8 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  30.8 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  30.8 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  30.8 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  30.8 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  30.8 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  30.8 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  31.1 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.95 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1773  siderophore-interacting protein  38.27 
 
 
354 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  32.4 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0911  siderophore-interacting protein  36.7 
 
 
234 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0168967  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.33 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17630  siderophore-interacting protein  31.06 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.868687  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  32.42 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0313  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.74 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  32.82 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.55 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.28 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32.4 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  32.02 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32.02 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  29.24 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  29.32 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.81 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  34.09 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  28.63 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  31.23 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.3 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  27.98 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  32.64 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32.64 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  29.58 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  32.88 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.31 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  32.86 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  38.18 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  29.18 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  27.62 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21440  siderophore-interacting protein  30.89 
 
 
277 aa  72  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal  0.530536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  28.68 
 
 
617 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.04 
 
 
281 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2220  Siderophore-interacting protein  30.54 
 
 
298 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683509  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  29.49 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1452  Siderophore-interacting protein  34.97 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.100932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2762  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  33.66 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  26.19 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.18 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  30.43 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  29.71 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  27.53 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  32.89 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  30.58 
 
 
247 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  37.84 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3539  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.25 
 
 
268 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  24.39 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3695  Siderophore-interacting protein  32.37 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3473  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.83 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100108  hitchhiker  0.00465132 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02939  predicted siderophore interacting protein  26.03 
 
 
254 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0631  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  26.03 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.231291  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02889  hypothetical protein  26.03 
 
 
254 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4383  siderophore-interacting protein  26.03 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347587  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03816  putative siderophore utilization protein  25.21 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3535  siderophore-interacting protein  26.03 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0880891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  26.03 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3506  siderophore-interacting protein  26.03 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.960559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.92 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  29.37 
 
 
259 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  30 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  31.36 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  30.94 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  29.05 
 
 
280 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3364  siderophore-interacting protein  25.62 
 
 
254 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0792017  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5549  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.22 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438451  normal  0.147517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  29.01 
 
 
340 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3251  siderophore-interacting protein  25.21 
 
 
254 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1601  Siderophore-interacting protein  29.88 
 
 
265 aa  63.5  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3647  siderophore-interacting protein  29.53 
 
 
273 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3524  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  24.28 
 
 
254 aa  63.2  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.326071  normal  0.260967 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>