189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2496 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2496  siderophore-interacting protein  100 
 
 		 333 aa  673    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3931  hypothetical protein  43.21 
 
 		 328 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal  0.760126 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0728  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32.29 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.198536  normal  0.463503 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3413  siderophore-interacting protein  34.66 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3678  siderophore-interacting protein  34.66 
 
 		 345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  33.44 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6722  Siderophore-interacting protein  30.81 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  35.71 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4240  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  33.01 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1773  siderophore-interacting protein  34.13 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4656  Siderophore-interacting protein  36.29 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0118  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  30.08 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.93 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  33.2 
 
 		 247 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0313  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.34 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  31.47 
 
 		 304 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  32.49 
 
 		 281 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  32.92 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  33.18 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  30.36 
 
 		 270 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  33.19 
 
 		 265 aa  99.4  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  31.12 
 
 		 273 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  32.74 
 
 		 253 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  30.87 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  30.71 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  31.54 
 
 		 279 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  31.25 
 
 		 275 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  31.25 
 
 		 275 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  31.25 
 
 		 275 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  31.25 
 
 		 275 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  31.25 
 
 		 275 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  31.25 
 
 		 275 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  31.25 
 
 		 275 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  30.35 
 
 		 284 aa  96.7  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  29.36 
 
 		 267 aa  96.3  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  32.4 
 
 		 277 aa  96.3  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  31.85 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.74 
 
 		 253 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.29 
 
 		 252 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  32.68 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  29.68 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  31.28 
 
 		 261 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.75 
 
 		 283 aa  92.8  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3524  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  27.78 
 
 		 254 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.326071  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  30.8 
 
 		 348 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  30.17 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.17 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.91 
 
 		 270 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  30 
 
 		 255 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21440  siderophore-interacting protein  31.02 
 
 		 277 aa  89  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal  0.530536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.67 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3400  siderophore-interacting protein  28.51 
 
 		 255 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0911  siderophore-interacting protein  31 
 
 		 234 aa  88.6  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0168967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3016  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.37 
 
 		 275 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3474  siderophore-interacting protein  28.51 
 
 		 255 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  26.91 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  30.9 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3508  siderophore-interacting protein  28.75 
 
 		 255 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000266465 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3570  siderophore-interacting protein  28.75 
 
 		 255 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  33.91 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0237  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.31 
 
 		 266 aa  86.7  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  35.33 
 
 		 278 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  27.95 
 
 		 277 aa  85.9  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1802  vibriobactin utilization protein ViuB  30.64 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2932  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.67 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453632  hitchhiker  0.000505579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  39.5 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  29.5 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  28.63 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  30.86 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  39.5 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  39.5 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  32.35 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  35.06 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  29.24 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3473  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.29 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100108  hitchhiker  0.00465132 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  27.94 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3731  Siderophore-interacting protein  30.25 
 
 		 356 aa  82.4  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  33.51 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  30.09 
 
 		 617 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  29.63 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3404  siderophore-interacting protein  27.66 
 
 		 255 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  27.73 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.28 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  30.64 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  28.51 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  28.51 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  29.58 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  33.92 
 
 		 623 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2220  Siderophore-interacting protein  28.75 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683509  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  28.69 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  25.1 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17630  siderophore-interacting protein  28.63 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.868687  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  28.81 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02939  predicted siderophore interacting protein  28.26 
 
 		 254 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0631  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.83 
 
 		 254 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.231291  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02889  hypothetical protein  28.26 
 
 		 254 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  30.83 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.3 
 
 		 271 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3535  siderophore-interacting protein  27.83 
 
 		 254 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0880891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  27.83 
 
 		 254 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>