More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1001 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1095  Inositol-phosphate phosphatase  99.63 
 
 
270 aa  557  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  100 
 
 
270 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  89.18 
 
 
270 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1078  inositol monophosphatase  79.55 
 
 
273 aa  441  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.701332  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1115  inositol-1(or 4)-monophosphatase  78.81 
 
 
274 aa  437  1e-122  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  69.63 
 
 
267 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  69.63 
 
 
267 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  5.60671e-06 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1397  inositol-phosphate phosphatase  70.74 
 
 
267 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  hitchhiker  0.000599171 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  66.29 
 
 
262 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  65.41 
 
 
284 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2605  inositol monophosphatase family protein  68.54 
 
 
267 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2553  inositol monophosphatase family protein  68.54 
 
 
267 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1664  inositol-1-monophosphatase  68.54 
 
 
267 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0475156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1441  inositol-1-monophosphatase  68.54 
 
 
267 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2168  inositol-1-monophosphatase  68.54 
 
 
267 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289149  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3149  inositol-1-monophosphatase  68.54 
 
 
267 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1934  inositol-1-monophosphatase  68.91 
 
 
363 aa  362  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2689  inositol-1-monophosphatase  68.54 
 
 
320 aa  362  5e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0179732  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  61.13 
 
 
330 aa  348  6e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  60.75 
 
 
431 aa  347  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1990  inositol-phosphate phosphatase  68.15 
 
 
267 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.410735 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2120  inositol monophosphatase  68.15 
 
 
267 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2085  inositol monophosphatase  68.15 
 
 
267 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5992  inositol monophosphatase  68.15 
 
 
267 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2104  inositol-phosphate phosphatase  68.15 
 
 
267 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.466762 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1196  inositol-phosphate phosphatase  67.41 
 
 
294 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0278883 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5391  inositol-1(or 4)-monophosphatase  67.41 
 
 
267 aa  342  3e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.268577  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  60 
 
 
300 aa  339  3e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  60.15 
 
 
273 aa  338  4e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  60.31 
 
 
268 aa  336  3e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.61138e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  59.54 
 
 
268 aa  335  5e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3293  inositol-1(or 4)-monophosphatase  61.89 
 
 
328 aa  328  5e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1380  inositol-phosphate phosphatase  61.13 
 
 
330 aa  327  1e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135454  hitchhiker  0.00587687 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0963  Inositol-phosphate phosphatase  62.26 
 
 
322 aa  326  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.220962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1045  inositol-phosphate phosphatase  62.26 
 
 
347 aa  325  4e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0806171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1681  inositol monophosphatase  63.32 
 
 
268 aa  322  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2070  inositol monophosphatase  61.13 
 
 
313 aa  321  9e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  60 
 
 
353 aa  321  1e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4248  inositol-phosphate phosphatase  60.82 
 
 
297 aa  320  1e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0646891  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2309  inositol-phosphate phosphatase  60.38 
 
 
304 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.315096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  61.78 
 
 
266 aa  313  1e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  53.82 
 
 
266 aa  289  4e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  53.82 
 
 
263 aa  289  4e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  52.42 
 
 
272 aa  288  9e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  56.2 
 
 
259 aa  285  6e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  54.02 
 
 
265 aa  283  2e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  7.61228e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  54.23 
 
 
267 aa  283  2e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  54.23 
 
 
267 aa  283  2e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  51.52 
 
 
271 aa  283  3e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  55.04 
 
 
259 aa  282  4e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  51.52 
 
 
271 aa  282  5e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  51.71 
 
 
267 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.55872e-06  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  53.05 
 
 
266 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  52.09 
 
 
267 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  53.41 
 
 
271 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  51.14 
 
 
272 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  8.05299e-09 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  50.76 
 
 
272 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  53.03 
 
 
271 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  50.38 
 
 
272 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  50.38 
 
 
272 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  51.33 
 
 
267 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.52035e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  51.33 
 
 
267 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  51.33 
 
 
267 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  51.33 
 
 
267 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  50.38 
 
 
272 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  51.71 
 
 
267 aa  275  5e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  51.71 
 
 
267 aa  275  7e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  53.64 
 
 
268 aa  274  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  51.71 
 
 
267 aa  274  9e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  51.71 
 
 
267 aa  274  9e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  51.53 
 
 
261 aa  273  1e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  50.19 
 
 
283 aa  274  1e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  51.53 
 
 
261 aa  273  1e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  51.14 
 
 
271 aa  273  2e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  50.19 
 
 
267 aa  273  2e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.20191e-08 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  50.57 
 
 
267 aa  271  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  53.82 
 
 
270 aa  271  8e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  49.81 
 
 
266 aa  267  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  5.50019e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1796  inositol-phosphate phosphatase  52.19 
 
 
269 aa  266  3e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  50.38 
 
 
267 aa  266  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  50.57 
 
 
267 aa  262  5e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  48.85 
 
 
267 aa  259  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  51.16 
 
 
267 aa  258  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  51.16 
 
 
267 aa  258  6e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  51.16 
 
 
267 aa  258  6e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  51.16 
 
 
267 aa  258  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  51.16 
 
 
267 aa  258  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  51.16 
 
 
267 aa  258  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  51.16 
 
 
267 aa  258  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  51.16 
 
 
267 aa  258  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  50.97 
 
 
267 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  50.97 
 
 
267 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  51.16 
 
 
267 aa  258  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  50.97 
 
 
267 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  50.97 
 
 
267 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  50.97 
 
 
267 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  50 
 
 
268 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1165  inositol monophosphatase  49.43 
 
 
267 aa  255  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.42854e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0438  inositol monophosphatase  49.43 
 
 
267 aa  255  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450003  hitchhiker  3.01386e-05 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1273  inositol monophosphatase  49.43 
 
 
267 aa  255  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  4.25107e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>