157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1709 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1709  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.676906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2017  hypothetical protein  99.28 
 
 		 277 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1538  hypothetical protein  92.83 
 
 		 278 aa  522  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642798  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2176  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  77.78 
 
 		 283 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.525625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2158  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  78.26 
 
 		 281 aa  431  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  66.55 
 
 		 271 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4454  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  65.82 
 
 		 268 aa  352  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1196  putative hemolysin-like protein  65.82 
 
 		 268 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0329892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1221  putative hemolysin-like protein  65.82 
 
 		 268 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1293  putative hemolysin-like protein  65.45 
 
 		 268 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1311  putative hemolysin-like protein  65.09 
 
 		 268 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  68.78 
 
 		 307 aa  348  4e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1997  putative hemolysin-like protein  64.36 
 
 		 268 aa  345  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1275  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  65.45 
 
 		 270 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599594  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2757  hypothetical protein  65.82 
 
 		 338 aa  342  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00398439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0797  hypothetical protein  65.45 
 
 		 272 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874102  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2849  hypothetical protein  64.36 
 
 		 270 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  0.909838 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1503  hypothetical protein  65.45 
 
 		 272 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1533  hypothetical protein  65.45 
 
 		 272 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1704  hypothetical protein  65.45 
 
 		 301 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1310  hypothetical protein  66.67 
 
 		 250 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0560  hypothetical protein  66.67 
 
 		 250 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0592  hypothetical protein  66.67 
 
 		 250 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12334  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0325  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  58.45 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0746411  normal  0.0207105 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1479  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N-acyltransferase  54.09 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2028  hypothetical protein  53.85 
 
 		 282 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.131913  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2379  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  53.74 
 
 		 278 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3452  hypothetical protein  56.85 
 
 		 255 aa  288  8e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320745  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2581  hypothetical protein  53.76 
 
 		 279 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571368 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0469  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  59.57 
 
 		 249 aa  285  8e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00940053  normal  0.968751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2243  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  51.59 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3934  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  54.62 
 
 		 250 aa  275  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.638634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2305  hypothetical protein  48.79 
 
 		 286 aa  271  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.050145  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0369  hypothetical protein  53.47 
 
 		 285 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2621  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  57.56 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0630357  normal  0.540771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1032  hypothetical protein  52.65 
 
 		 286 aa  267  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6049  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  51.09 
 
 		 256 aa  225  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0583  putative hemolysin-like protein  49.6 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2736  putative hemolysin  46.58 
 
 		 271 aa  205  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0059  hypothetical protein  43.25 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0726  hypothetical protein  45.68 
 
 		 258 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0874  conserved hypothetical protein, predicted autoinducer synthesis protein family  45.68 
 
 		 258 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.936705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4353  hypothetical protein  45.95 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1121  hypothetical protein  46.32 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37760  hypothetical protein  44.55 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4048  hypothetical protein  44.59 
 
 		 251 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2322  putative hemolysin  42.68 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1287  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  41.96 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4066  hypothetical protein  44.03 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311734  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0990  hypothetical protein  44.65 
 
 		 251 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56560  hypothetical protein  43.64 
 
 		 251 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1126  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  44.09 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4921  hypothetical protein  43.64 
 
 		 251 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4464  hypothetical protein  43.72 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.0135664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0963  hypothetical protein  43.26 
 
 		 251 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.07893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0924  hypothetical protein  43.26 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1873  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  40.16 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.447204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1919  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  40.16 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456889  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1853  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  40.16 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2103  hypothetical protein  41.95 
 
 		 287 aa  168  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1049  putative hemolysin  38.49 
 
 		 277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13043  hypothetical protein  42.42 
 
 		 246 aa  161  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000906572  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4257  hypothetical protein  40.25 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0716  hypothetical protein  36.1 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000130069  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2912  hypothetical protein  40.26 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1900  hypothetical protein  41.77 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0333  putative hemolysin-like protein  37.41 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515717  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1440  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  41.03 
 
 		 261 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.907823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3535  hypothetical protein  37.85 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3258  hypothetical protein  42.31 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1654  hypothetical protein  39.55 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.816423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4417  hypothetical protein  39.23 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704988  normal  0.744356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4880  hypothetical protein  38.85 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.055868  normal  0.748823 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0050  hypothetical protein  38.89 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0318  putative hemolysin  37.99 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3681  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  38.71 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1208  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  36.18 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1116  hypothetical protein  38.76 
 
 		 332 aa  142  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4926  hypothetical protein  38.08 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3632  hypothetical protein  38.63 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0412  hypothetical protein  36.76 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.666795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0035  hypothetical protein  38.1 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  36.9 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4721  hypothetical protein  37.69 
 
 		 332 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325273  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0160  hypothetical protein  37.7 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4208  hypothetical protein  37.55 
 
 		 330 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.159321 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0408  hypothetical protein  35.97 
 
 		 337 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0418  hypothetical protein  37.3 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0314  hypothetical protein  36.61 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0944  Putative hemolysin-like protein  37.55 
 
 		 288 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000783609  normal  0.05177 
 
 
-
 
NC_004310  BR0148  hypothetical protein  35.71 
 
 		 281 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2436  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  36.21 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586603 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0143  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1335  putative hemolysin-like protein  36.71 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1750  hypothetical protein  37.12 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1138  hypothetical protein  28.86 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.194098  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0028  hypothetical protein  34.39 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3597  hypothetical protein  33.7 
 
 		 341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.485263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0699  hypothetical protein  35.18 
 
 		 315 aa  125  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3807  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.08 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>