More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0899 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  70.99 
 
 
648 aa  895  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  62.4 
 
 
632 aa  723  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  60.31 
 
 
629 aa  733  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  70.94 
 
 
660 aa  876  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  70.94 
 
 
660 aa  876  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  70.94 
 
 
648 aa  877  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  70.74 
 
 
649 aa  892  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  62.75 
 
 
640 aa  736  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  71.25 
 
 
648 aa  879  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  58.49 
 
 
640 aa  696  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  63.12 
 
 
628 aa  744  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4771  ABC transporter related  62.02 
 
 
635 aa  723  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  69.97 
 
 
649 aa  881  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  57.66 
 
 
648 aa  675  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  100 
 
 
663 aa  1335  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  70.94 
 
 
660 aa  877  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  60.94 
 
 
648 aa  746  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  71.32 
 
 
645 aa  901  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  70.59 
 
 
661 aa  891  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  70.9 
 
 
649 aa  896  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  70.14 
 
 
641 aa  892  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  63.58 
 
 
629 aa  738  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  61.44 
 
 
641 aa  745  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  2.49616e-07 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  63.01 
 
 
628 aa  746  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  70.59 
 
 
661 aa  891  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  70.94 
 
 
648 aa  877  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2171  ABC transporter related  59.29 
 
 
645 aa  678  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380674  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  59.69 
 
 
644 aa  700  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  75.12 
 
 
641 aa  934  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  70.9 
 
 
649 aa  896  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  65.09 
 
 
626 aa  761  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  62.66 
 
 
634 aa  735  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  69.94 
 
 
1065 aa  877  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  59.69 
 
 
646 aa  694  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  63.72 
 
 
626 aa  786  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  89.92 
 
 
636 aa  1099  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  71.83 
 
 
688 aa  893  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  70.94 
 
 
648 aa  877  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  98.27 
 
 
636 aa  1216  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  75.35 
 
 
642 aa  942  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  59.43 
 
 
631 aa  672  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  54.06 
 
 
650 aa  619  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  50.45 
 
 
653 aa  596  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  49.84 
 
 
632 aa  596  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  49.38 
 
 
640 aa  593  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  48.36 
 
 
637 aa  590  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  48.36 
 
 
637 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  48.36 
 
 
637 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  49.31 
 
 
649 aa  580  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  48.48 
 
 
648 aa  578  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  49.53 
 
 
642 aa  581  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  52.63 
 
 
632 aa  577  1e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  46.92 
 
 
647 aa  578  1e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  48.17 
 
 
648 aa  575  1e-163  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  52.14 
 
 
631 aa  572  1e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  50.71 
 
 
635 aa  569  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17313e-05 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  51.01 
 
 
637 aa  569  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  48.11 
 
 
635 aa  571  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.10719e-06  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  46.82 
 
 
638 aa  568  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  47.88 
 
 
637 aa  571  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  48.35 
 
 
639 aa  566  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2512  ABC transporter related  49.69 
 
 
620 aa  563  1e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926021  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  47.95 
 
 
635 aa  562  1e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2893  ABC transporter, ATP-binding protein  49.69 
 
 
620 aa  563  1e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.669618  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  51.25 
 
 
641 aa  565  1e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.59167e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  50 
 
 
643 aa  559  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  47.95 
 
 
635 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  48.11 
 
 
635 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  47.95 
 
 
635 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  47.95 
 
 
635 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  46.9 
 
 
640 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  47.95 
 
 
635 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.87784e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2065  ABC transporter ATPase component  48.28 
 
 
636 aa  555  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  47.95 
 
 
635 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  47.95 
 
 
635 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.77813e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  49.23 
 
 
642 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  47.56 
 
 
639 aa  555  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  46.69 
 
 
635 aa  555  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  47.04 
 
 
640 aa  555  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  50.32 
 
 
627 aa  553  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 
646 aa  552  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  47.98 
 
 
642 aa  553  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3277  ABC transporter, ATP-binding protein Uup  45.03 
 
 
645 aa  552  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  46.48 
 
 
641 aa  552  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  48.19 
 
 
639 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  49.92 
 
 
642 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  46.9 
 
 
640 aa  551  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  47.49 
 
 
634 aa  549  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  4.34555e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  49.92 
 
 
642 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  46.73 
 
 
640 aa  551  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  49.46 
 
 
642 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  47 
 
 
635 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  46.49 
 
 
641 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  46.49 
 
 
641 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  47 
 
 
635 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  46.49 
 
 
641 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  46.49 
 
 
641 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  47 
 
 
635 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  47.34 
 
 
639 aa  544  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  4.85056e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  47 
 
 
635 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>