26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2679 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2679  Protein of unknown function DUF1847  100 
 
 		 221 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2788  hypothetical protein  59.13 
 
 		 218 aa  266  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4575  Protein of unknown function DUF1847  55.29 
 
 		 218 aa  244  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000363898  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2021  hypothetical protein  55.07 
 
 		 222 aa  239  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.457278 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1219  Protein of unknown function DUF1847  53.7 
 
 		 226 aa  240  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000101806  hitchhiker  0.00063854 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1986  hypothetical protein  54.07 
 
 		 226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1436  Protein of unknown function DUF1847  55.02 
 
 		 226 aa  232  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1064  Protein of unknown function DUF1847  50 
 
 		 219 aa  224  5.0000000000000005e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.253375  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0127  hypothetical protein  46.43 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0197802  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3326  hypothetical protein  45.18 
 
 		 243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0284  hypothetical protein  44.02 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0086  Protein of unknown function DUF1847  44.25 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43245e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0104  Protein of unknown function DUF1847  43.81 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3043  hypothetical protein  40.27 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0096  hypothetical protein  43.59 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.740238  hitchhiker  0.00737296 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1805  hypothetical protein  45.98 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.251054  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0656  hypothetical protein  45.71 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3053  hypothetical protein  39.82 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2077  hypothetical protein  38.35 
 
 		 191 aa  145  6e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2927  Protein of unknown function DUF1847  48.15 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.727853 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0459  Protein of unknown function DUF1847  36.36 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1137  hypothetical protein  35.96 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000486783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1050  hypothetical protein  38.07 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1395  hypothetical protein  44.03 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0564  hypothetical protein  38.79 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129187  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0637  hypothetical protein  35.17 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>