37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0048 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0048  protein of unknown function DUF1239  100 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  83.03 
 
 		 256 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  80.65 
 
 		 243 aa  360  8e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  73.79 
 
 		 244 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  57.32 
 
 		 258 aa  279  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  61.68 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  52.16 
 
 		 233 aa  243  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0067  hypothetical protein  35.62 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0156  protein of unknown function DUF1239  35.58 
 
 		 250 aa  118  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.535072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5274  hypothetical protein  34.8 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0167  hypothetical protein  31.86 
 
 		 237 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5923  protein of unknown function DUF1239  33.16 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0150  hypothetical protein  29.61 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0155  hypothetical protein  28.85 
 
 		 217 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5468  hypothetical protein  30.85 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.131274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0571  hypothetical protein  29.36 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0408  hypothetical protein  29.33 
 
 		 221 aa  99.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2426  protein of unknown function DUF1239  30.93 
 
 		 253 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.289708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3670  hypothetical protein  28.99 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2721  protein of unknown function DUF1239  30.16 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2498  hypothetical protein  30.16 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.238493  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1370  hypothetical protein  26.24 
 
 		 214 aa  91.7  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  28.27 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0061  protein of unknown function DUF1239  28.37 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0018  hypothetical protein  27.08 
 
 		 222 aa  89  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0045  protein of unknown function DUF1239  31.47 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1691  hypothetical protein  26.74 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1154  hypothetical protein  29.71 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2815  hypothetical protein  29.71 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.447323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2773  hypothetical protein  31.03 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1671  hypothetical protein  25.87 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593803  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3250  hypothetical protein  25 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2904  hypothetical protein  21.49 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.796329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0013  hypothetical protein  21.21 
 
 		 274 aa  48.9  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4955  hypothetical protein  27.08 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0335  protein of unknown function DUF1239  25.15 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143778  normal  0.315506 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2342  hypothetical protein  18.5 
 
 		 219 aa  43.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.25534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>