More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4541 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  100 
 
 
453 aa  904    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  80.84 
 
 
454 aa  707    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  48.33 
 
 
438 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  45.56 
 
 
435 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  40.35 
 
 
451 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  34.3 
 
 
441 aa  277  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  33.86 
 
 
441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  35.04 
 
 
428 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  36.38 
 
 
429 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  38.62 
 
 
438 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  38.02 
 
 
439 aa  261  1e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  38.71 
 
 
437 aa  260  3e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  35.27 
 
 
443 aa  260  4e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
429 aa  260  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  35.43 
 
 
459 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  36.9 
 
 
431 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  35.7 
 
 
431 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  34.73 
 
 
424 aa  253  7e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  39.06 
 
 
427 aa  250  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  38.11 
 
 
440 aa  249  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  37.75 
 
 
428 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  32.37 
 
 
433 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  35.65 
 
 
434 aa  246  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  39.82 
 
 
424 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  34.9 
 
 
431 aa  246  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.14 
 
 
433 aa  245  9e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.67 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  32.14 
 
 
432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  35.03 
 
 
427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  36.11 
 
 
431 aa  244  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  31.92 
 
 
433 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.22 
 
 
433 aa  243  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  31.39 
 
 
433 aa  243  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  31.92 
 
 
433 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  31.92 
 
 
433 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  31.92 
 
 
433 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
433 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  34.3 
 
 
428 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.77 
 
 
433 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  32.93 
 
 
413 aa  237  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  39.86 
 
 
437 aa  236  5.0000000000000005e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.49 
 
 
466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  31.85 
 
 
424 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  38.12 
 
 
424 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  34 
 
 
437 aa  232  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  32.44 
 
 
435 aa  231  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  32.44 
 
 
437 aa  230  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  35.03 
 
 
457 aa  229  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  37.19 
 
 
424 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  34.21 
 
 
416 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  33.11 
 
 
428 aa  227  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  36.3 
 
 
422 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  32.84 
 
 
447 aa  223  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  38.57 
 
 
424 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  35.96 
 
 
433 aa  219  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  38.22 
 
 
442 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0591  FolC bifunctional protein  34.02 
 
 
474 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  30.96 
 
 
432 aa  216  7e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  38.31 
 
 
426 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  34.74 
 
 
429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  38.52 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  32.44 
 
 
465 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  36.28 
 
 
813 aa  213  5.999999999999999e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  29.45 
 
 
438 aa  213  5.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  32.96 
 
 
429 aa  211  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  34.23 
 
 
407 aa  210  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  38.25 
 
 
463 aa  209  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  38.61 
 
 
381 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  35.98 
 
 
810 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  31.31 
 
 
404 aa  207  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1754  FolC bifunctional protein  32.94 
 
 
423 aa  206  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.686494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1720  FolC bifunctional protein  32.94 
 
 
423 aa  206  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  37.53 
 
 
425 aa  206  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  34.57 
 
 
817 aa  204  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1504  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  32.31 
 
 
420 aa  203  4e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000264137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  30.91 
 
 
408 aa  202  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  33.84 
 
 
840 aa  202  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1092  FolC bifunctional protein  31.1 
 
 
410 aa  202  9e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0344  FolC bifunctional protein  29.12 
 
 
435 aa  201  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  36.34 
 
 
452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  29.95 
 
 
422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2472  FolC bifunctional protein  36.36 
 
 
448 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.829093 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  39.09 
 
 
403 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  34.59 
 
 
427 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2622  FolC bifunctional protein  30.14 
 
 
413 aa  196  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132417  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  35.81 
 
 
452 aa  192  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  34.8 
 
 
847 aa  192  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1117  folylpolyglutamate synthase  29.42 
 
 
420 aa  192  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  37.02 
 
 
414 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0918  FolC bifunctional protein  37.6 
 
 
404 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  34.27 
 
 
442 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  34.46 
 
 
440 aa  190  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1227  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.35 
 
 
421 aa  189  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113059  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  35.03 
 
 
878 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  37.98 
 
 
444 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  37.33 
 
 
450 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  32.2 
 
 
438 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  28.89 
 
 
404 aa  187  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  34.58 
 
 
461 aa  187  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1208  FolC bifunctional protein  35.65 
 
 
445 aa  186  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>