73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0872 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2455  hypothetical protein  62.25 
 
 		 538 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0872  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1069    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3025  hypothetical protein  34.5 
 
 		 546 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.487513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0671  protein of unknown function DUF342  32.89 
 
 		 545 aa  251  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38243e-32 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0512  hypothetical protein  31.52 
 
 		 546 aa  250  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3642  hypothetical protein  32.65 
 
 		 544 aa  246  8e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000393022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0090  protein of unknown function DUF342  29.44 
 
 		 565 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1709  hypothetical protein  28.49 
 
 		 534 aa  183  9.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2978  hypothetical protein  28.31 
 
 		 555 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0826  hypothetical protein  31.52 
 
 		 563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0674  hypothetical protein  29.81 
 
 		 563 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0539  hypothetical protein  31.51 
 
 		 555 aa  161  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3273  hypothetical protein  29.81 
 
 		 563 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3451  hypothetical protein  29.81 
 
 		 563 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113855 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1695  hypothetical protein  32.16 
 
 		 562 aa  160  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0879  hypothetical protein  30.09 
 
 		 467 aa  160  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00425584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4141  hypothetical protein  28.78 
 
 		 556 aa  160  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.5265 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3979  hypothetical protein  32.56 
 
 		 556 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0568  hypothetical protein  30.79 
 
 		 556 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0805  hypothetical protein  28.63 
 
 		 562 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3531  hypothetical protein  31.39 
 
 		 562 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0830  protein of unknown function DUF342  31.11 
 
 		 562 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000204321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0837  hypothetical protein  31.11 
 
 		 562 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3684  hypothetical protein  29.63 
 
 		 562 aa  156  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3165  hypothetical protein  30.1 
 
 		 562 aa  154  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0596  hypothetical protein  29.94 
 
 		 554 aa  150  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1423  protein of unknown function DUF342  27.91 
 
 		 622 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000579847  normal  0.370296 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000996  predicted polymerase  28.1 
 
 		 559 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717686  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3231  hypothetical protein  28.32 
 
 		 556 aa  147  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02406  hypothetical protein  26.11 
 
 		 551 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122562  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07053  hypothetical protein  29.58 
 
 		 566 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1305  protein of unknown function DUF342  32.08 
 
 		 530 aa  141  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.431943  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0176  protein of unknown function DUF342  29.97 
 
 		 660 aa  138  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2173  hypothetical protein  26.4 
 
 		 552 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.819375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0498  hypothetical protein  27.61 
 
 		 542 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.578621  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0010  hypothetical protein  28.77 
 
 		 547 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.736924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  23.97 
 
 		 611 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0158  hypothetical protein  31.71 
 
 		 556 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2684  hypothetical protein  28.57 
 
 		 532 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0194  hypothetical protein  27.97 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0473  hypothetical protein  25.9 
 
 		 467 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1511  hypothetical protein  29.8 
 
 		 527 aa  117  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2682  hypothetical protein  25.17 
 
 		 656 aa  114  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254687  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2143  protein of unknown function DUF342  25.94 
 
 		 461 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0160634  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0219  protein of unknown function DUF342  28.45 
 
 		 501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.102298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  26.5 
 
 		 530 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1663  hypothetical protein  26.09 
 
 		 459 aa  110  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000175912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0192  hypothetical protein  28.01 
 
 		 455 aa  107  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1361  polymerase  29.01 
 
 		 653 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  26.54 
 
 		 463 aa  97.8  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1231  hypothetical protein  24.84 
 
 		 462 aa  97.1  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0389  protein of unknown function DUF342  23.82 
 
 		 578 aa  90.9  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0657  hypothetical protein  27.12 
 
 		 509 aa  86.7  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0881  hypothetical protein  23.43 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000540176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2234  hypothetical protein  27.72 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2246  protein of unknown function DUF342  24.22 
 
 		 520 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1534  polymerase  23.53 
 
 		 629 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.451593  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1398  hypothetical protein  24.41 
 
 		 728 aa  79.3  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0394  hypothetical protein  25.35 
 
 		 543 aa  78.2  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000249945  normal  0.153411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3178  hypothetical protein  22.47 
 
 		 529 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0028  protein of unknown function DUF342  26.72 
 
 		 525 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1534  hypothetical protein  22.96 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.196772  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0452  protein of unknown function DUF342  37.36 
 
 		 603 aa  74.7  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0823  hypothetical protein  30.56 
 
 		 691 aa  74.7  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00604121  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1256  protein of unknown function DUF342  24.35 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.912515  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0273  hypothetical protein  23.32 
 
 		 634 aa  66.2  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1718  hypothetical protein  25.08 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0679747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1859  hypothetical protein  29.08 
 
 		 603 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2318  hypothetical protein  28.89 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575561 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0251  protein of unknown function DUF342  23.04 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0226778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4099  protein of unknown function DUF342  30 
 
 		 598 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000308473  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1631  hypothetical protein  23.1 
 
 		 378 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.83823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0429  hypothetical protein  27.52 
 
 		 574 aa  45.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>