59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2643 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2643  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
377 aa  766    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624519  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3879  GDSL family lipase  52.69 
 
 
414 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3061  GDSL family lipase  51.32 
 
 
415 aa  396  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3482  lipolytic protein G-D-S-L family  51.17 
 
 
409 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1831  GDSL family lipase  47.37 
 
 
418 aa  342  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0964  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.99 
 
 
407 aa  339  5e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263974  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0961  GDSL family lipase  42.4 
 
 
439 aa  292  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270574 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09287  extracellular GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00820)  42.01 
 
 
425 aa  290  4e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.879656 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2328  lipolytic protein G-D-S-L family  42.13 
 
 
429 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  0.694344 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14350  lysophospholipase L1-like esterase  44 
 
 
407 aa  280  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20820  Lipolytic enzyme, G-D-S-L domain protein  41.94 
 
 
451 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  41.33 
 
 
542 aa  265  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2856  GDSL family lipase  42.31 
 
 
452 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000379569  hitchhiker  0.00852131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23690  putative secreted protein  40.05 
 
 
442 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2556  lipolytic protein G-D-S-L family  41.78 
 
 
414 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1244  lipolytic protein G-D-S-L family  40.84 
 
 
404 aa  256  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2273  lipolytic protein G-D-S-L family  41.05 
 
 
420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4089  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1567  GDSL-like lipase/acylhydrolase family protein  43.62 
 
 
422 aa  252  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130924  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3984  lipolytic protein G-D-S-L family  40.55 
 
 
430 aa  252  8.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.767273  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3096  lipase/acylhydrolase, putative  39.02 
 
 
428 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1245  lipolytic protein G-D-S-L family  39.9 
 
 
414 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4719  lipolytic protein G-D-S-L family  39.22 
 
 
407 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2776  lipolytic protein G-D-S-L family  41.49 
 
 
487 aa  240  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0006  lipase/acylhydrolase, putative  38.5 
 
 
425 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000023586  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1595  lipolytic protein G-D-S-L family  40.89 
 
 
418 aa  239  5.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3539  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  38.5 
 
 
425 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000245982  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2571  lipase/acylhydrolase, putative  38.5 
 
 
425 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000716305  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1986  putative lipase/acylhydrolase  38.5 
 
 
425 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000018938  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7004  GDSL family lipase  38.46 
 
 
416 aa  239  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3110  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  38.5 
 
 
483 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.000000000002324  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0013  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.5 
 
 
483 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000198  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2481  GDSL family lipase  38.83 
 
 
450 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3835  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  37.98 
 
 
425 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00947114  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2528  GDSL family lipase  38.48 
 
 
437 aa  232  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.744163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2664  GDSL family lipase  38.03 
 
 
423 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  decreased coverage  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0233  GDSL family lipase  39.64 
 
 
421 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000340097  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4791  lipolytic protein G-D-S-L family  39.67 
 
 
422 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2775  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.06 
 
 
421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000857041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0331  GDSL family lipase  39.06 
 
 
421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381329  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0259  GDSL family lipase  38.54 
 
 
423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000511681  normal  0.138993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0297  lipase/acylhydrolase  39.11 
 
 
423 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223769  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0311  GDSL family lipase  38.8 
 
 
421 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000971594  hitchhiker  0.00755719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  36.36 
 
 
794 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3660  lipolytic protein G-D-S-L family  38.76 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000531698  hitchhiker  0.0000015866 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0250  GDSL family lipase  37.82 
 
 
421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000480307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3430  lipolytic protein  37.24 
 
 
423 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000013234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2832  lipolytic protein G-D-S-L family  36.34 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000255461  decreased coverage  0.0000190518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2070  lipolytic protein G-D-S-L family  37.57 
 
 
395 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397214  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0775  lipolytic protein G-D-S-L family  33.7 
 
 
646 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812985  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3774  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.65 
 
 
384 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000241856  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0237  hypothetical protein  27.45 
 
 
376 aa  149  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3614  lipolytic protein G-D-S-L family  42.72 
 
 
220 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4331  hypothetical protein  34.52 
 
 
326 aa  139  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46242  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2838  lipolytic protein G-D-S-L family  29.92 
 
 
399 aa  123  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.902078  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  28.14 
 
 
1375 aa  86.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3633  hypothetical protein  52 
 
 
226 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0740  alpha/beta hydrolase fold family protein  25.4 
 
 
573 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0142196  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0724  putative lipase  25.4 
 
 
573 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0711  lipolytic protein G-D-S-L family  28.38 
 
 
241 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>