More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2659 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 130 aa  244  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  66.04 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  55.77 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  55.77 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  54.87 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  54.81 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  56.73 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  55.77 
 
 		 104 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  55.77 
 
 		 104 aa  110  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  57.28 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  52.88 
 
 		 106 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  48.41 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  55.77 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  48.41 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  54.81 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  54.9 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  53.85 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  54.29 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  53.77 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  54.37 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  58.25 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  55.77 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 104 aa  106  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  56 
 
 		 104 aa  105  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  52.94 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  52.43 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  52.94 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  52.94 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  52.94 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  52.94 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  52.94 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  52.29 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  52.94 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  52.94 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  54.72 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  54.72 
 
 		 106 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  53 
 
 		 104 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  53 
 
 		 104 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  50.94 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  52.83 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  50.94 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  51.89 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  51.89 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  49.53 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  50.94 
 
 		 106 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  50.94 
 
 		 106 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  50.94 
 
 		 106 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  54.81 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  49.06 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  51.92 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  51.92 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  51.92 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  51.92 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  51.92 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  51.92 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  51.92 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  50.98 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  49.52 
 
 		 109 aa  97.1  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  52.43 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 105 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 105 aa  95.9  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3611  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2650  small multidrug resistance protein  52.38 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50.48 
 
 		 107 aa  95.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  52.94 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  47.66 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 		 106 aa  94.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  49 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  48.11 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5065  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.929302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  49.06 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  48.11 
 
 		 108 aa  92.8  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  48.11 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  47.12 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 104 aa  92  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  47.12 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>