24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3512 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3512  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  505  1e-142  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3807  hypothetical protein  87.4 
 
 
254 aa  451  1e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2992  putative transmembrane protein  66.67 
 
 
236 aa  330  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0809  hypothetical protein  43.87 
 
 
253 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4959  hypothetical protein  41.27 
 
 
253 aa  182  5e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5047  hypothetical protein  41.27 
 
 
253 aa  182  5e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.713313  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5340  hypothetical protein  41.27 
 
 
253 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236442  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0051  hypothetical protein  34.78 
 
 
252 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  35.86 
 
 
261 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6348  hypothetical protein  36.89 
 
 
253 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.291018 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4081  hypothetical protein  33.59 
 
 
267 aa  145  4e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0344  hypothetical protein  34.24 
 
 
267 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123778  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0619  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0794565 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0153  hypothetical protein  37.62 
 
 
309 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2130  hypothetical protein  29.73 
 
 
261 aa  85.5  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128783  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  24.91 
 
 
263 aa  65.1  1e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  25.81 
 
 
265 aa  59.7  4e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  25.81 
 
 
275 aa  59.7  4e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  25.81 
 
 
275 aa  59.7  4e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  28.02 
 
 
260 aa  58.9  7e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  25.81 
 
 
260 aa  53.9  3e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  21.72 
 
 
263 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  24.86 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4845  hypothetical protein  26 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.754626  normal  0.106217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>