172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1430 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1430  Na/Pi cotransporter II-related  100 
 
 		 548 aa  1085    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3851  Na/Pi cotransporter II-related  74.5 
 
 		 553 aa  749    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1260  Na/Pi-cotransporter II-related protein  70.22 
 
 		 553 aa  703    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170885  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  70.22 
 
 		 576 aa  737    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  73.09 
 
 		 552 aa  778    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  70.83 
 
 		 556 aa  746    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  71.19 
 
 		 556 aa  746    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  65.32 
 
 		 577 aa  700    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  60.38 
 
 		 559 aa  625  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  50.92 
 
 		 563 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0218  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  52.13 
 
 		 562 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4205  Na+/phosphate symporter  53.42 
 
 		 565 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  50.28 
 
 		 558 aa  508  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  51.12 
 
 		 582 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  50.56 
 
 		 582 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0511  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  52.61 
 
 		 561 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.791872  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  48.32 
 
 		 549 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5082  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  46.31 
 
 		 552 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0387022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0145  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  45.41 
 
 		 552 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610668  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  45.29 
 
 		 552 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  45.41 
 
 		 552 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0069  Na+/Pi-cotransporter:Na/Pi cotransporter II-related  47.27 
 
 		 550 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4443  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  48.13 
 
 		 546 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  45.99 
 
 		 548 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0034  Na/Pi cotransporter II-like  46.27 
 
 		 552 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148674  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3770  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  45.62 
 
 		 548 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0118  Na/Pi cotransporter family protein  47.24 
 
 		 550 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03892  predicted transporter  44.84 
 
 		 543 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3977  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  44.84 
 
 		 543 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5490  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  45.03 
 
 		 543 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4010  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  44.84 
 
 		 543 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0189192 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03852  hypothetical protein  44.84 
 
 		 543 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4473  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  44.84 
 
 		 543 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4256  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  44.84 
 
 		 543 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4564  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  44.84 
 
 		 543 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4514  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  44.67 
 
 		 543 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0223  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  45.03 
 
 		 543 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0371  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  45.49 
 
 		 548 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4601  sodium-dependent inorganic phosphate  44.28 
 
 		 543 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4441  sodium-dependent inorganic phosphate  44.28 
 
 		 543 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4402  sodium-dependent inorganic phosphate  44.28 
 
 		 543 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433029  normal  0.437823 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4527  sodium-dependent inorganic phosphate  44.28 
 
 		 543 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4524  sodium-dependent inorganic phosphate  44.28 
 
 		 543 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0767506  normal  0.405258 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0751  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  45.56 
 
 		 570 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0476826  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0461  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  42.99 
 
 		 548 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  42.96 
 
 		 563 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  40.37 
 
 		 565 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01780  Na/Pi cotransporter II protein  44.69 
 
 		 568 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  39.85 
 
 		 565 aa  363  6e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.71 
 
 		 548 aa  337  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  36.67 
 
 		 548 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1792  Na/Pi-cotransporter II-related protein  39.31 
 
 		 553 aa  321  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3965  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.53 
 
 		 547 aa  319  9e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  39.52 
 
 		 601 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  37.16 
 
 		 561 aa  317  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4873  Na+cotransporter  32.84 
 
 		 557 aa  316  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00339774  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  33.64 
 
 		 556 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.43 
 
 		 562 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_004310  BR1481  Na/Pi-cotransporter family protein  33.64 
 
 		 558 aa  301  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1685  Na+ cotransporter  33.82 
 
 		 560 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2784  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.85 
 
 		 548 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1437  Na/Pi-cotransporter family protein  33.46 
 
 		 558 aa  298  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3048  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.59 
 
 		 548 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3291  putative Na+/phosphate symporter  38.09 
 
 		 564 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3286  hypothetical protein  38.83 
 
 		 561 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.969266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7452  putative Na+/phosphate symporter  34.79 
 
 		 578 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337065  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4023  Na+/Pi-cotransporter  37.71 
 
 		 561 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0855  Na+/Pi-cotransporter  32.64 
 
 		 548 aa  259  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0816  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  35.9 
 
 		 542 aa  242  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.568995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.49 
 
 		 567 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0969  Na+/Pi-cotransporter family protein  30.47 
 
 		 562 aa  241  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0614993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5541  hypothetical protein  36.59 
 
 		 555 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  29.49 
 
 		 535 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63750  hypothetical protein  36.13 
 
 		 555 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.81 
 
 		 566 aa  223  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.33 
 
 		 563 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.98 
 
 		 556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.68 
 
 		 558 aa  206  8e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  24.06 
 
 		 537 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.4 
 
 		 643 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.35 
 
 		 549 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  23.31 
 
 		 537 aa  190  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.88 
 
 		 539 aa  187  4e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.09 
 
 		 541 aa  186  8e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.09 
 
 		 541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.14 
 
 		 541 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.56 
 
 		 538 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  26.5 
 
 		 559 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.77 
 
 		 541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.81 
 
 		 554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.72 
 
 		 565 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1565  Na+/phosphate symporter  26.73 
 
 		 562 aa  170  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9722500000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1734  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.19 
 
 		 564 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2438  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.57 
 
 		 636 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1230  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.73 
 
 		 564 aa  156  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  23.15 
 
 		 551 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21650  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.48 
 
 		 548 aa  154  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314807  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0213  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.99 
 
 		 556 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.550042  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  22.96 
 
 		 551 aa  153  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  22.96 
 
 		 551 aa  153  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>