173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3291 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3291  putative Na+/phosphate symporter  100 
 
 
564 aa  1079    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4023  Na+/Pi-cotransporter  98.75 
 
 
561 aa  1060    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3286  hypothetical protein  88.57 
 
 
561 aa  806    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.969266  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  46.79 
 
 
548 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  42.02 
 
 
563 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2784  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  46.86 
 
 
548 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3048  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  46.22 
 
 
548 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3965  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  45.35 
 
 
547 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162548  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  43.95 
 
 
565 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0816  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  47.44 
 
 
542 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.568995  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  41.57 
 
 
576 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  41.62 
 
 
577 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.87 
 
 
556 aa  365  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.68 
 
 
556 aa  365  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  41.44 
 
 
563 aa  364  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.22 
 
 
552 aa  359  7e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4205  Na+/phosphate symporter  42.31 
 
 
565 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  39.4 
 
 
582 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0218  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  39.93 
 
 
562 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720634  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  39.55 
 
 
582 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0034  Na/Pi cotransporter II-like  39.32 
 
 
552 aa  342  8e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148674  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  39.7 
 
 
549 aa  342  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1260  Na/Pi-cotransporter II-related protein  41.31 
 
 
553 aa  339  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170885  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0511  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  41.93 
 
 
561 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.791872  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  39.74 
 
 
558 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.94 
 
 
552 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.75 
 
 
552 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.75 
 
 
559 aa  331  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0145  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.56 
 
 
552 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610668  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5082  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.37 
 
 
552 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0387022 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  38.85 
 
 
561 aa  326  9e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0069  Na+/Pi-cotransporter:Na/Pi cotransporter II-related  39.13 
 
 
550 aa  323  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1430  Na/Pi cotransporter II-related  39.4 
 
 
548 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  35.86 
 
 
556 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.04 
 
 
601 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  40.18 
 
 
548 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0118  Na/Pi cotransporter family protein  39.32 
 
 
550 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3851  Na/Pi cotransporter II-related  39.52 
 
 
553 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1481  Na/Pi-cotransporter family protein  34.67 
 
 
558 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0223  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.49 
 
 
543 aa  311  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4873  Na+cotransporter  37.77 
 
 
557 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00339774  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1437  Na/Pi-cotransporter family protein  34.67 
 
 
558 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1685  Na+ cotransporter  34.59 
 
 
560 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3770  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.43 
 
 
548 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.66 
 
 
565 aa  307  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4443  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  39.78 
 
 
546 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.24 
 
 
548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0371  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.87 
 
 
548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5490  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  38.11 
 
 
543 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03892  predicted transporter  38.11 
 
 
543 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3977  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.11 
 
 
543 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03852  hypothetical protein  38.11 
 
 
543 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4010  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.11 
 
 
543 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0189192 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4256  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  38.11 
 
 
543 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4564  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  38.11 
 
 
543 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4514  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  38.11 
 
 
543 aa  303  7.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4473  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  38.11 
 
 
543 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4441  sodium-dependent inorganic phosphate  38.11 
 
 
543 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4524  sodium-dependent inorganic phosphate  38.11 
 
 
543 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0767506  normal  0.405258 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4527  sodium-dependent inorganic phosphate  38.11 
 
 
543 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4402  sodium-dependent inorganic phosphate  38.11 
 
 
543 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433029  normal  0.437823 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4601  sodium-dependent inorganic phosphate  38.11 
 
 
543 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0751  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.92 
 
 
570 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0476826  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0461  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38 
 
 
548 aa  293  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01780  Na/Pi cotransporter II protein  39.06 
 
 
568 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.82 
 
 
562 aa  283  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1792  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.8 
 
 
553 aa  280  7e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0855  Na+/Pi-cotransporter  35.97 
 
 
548 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.46 
 
 
567 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7452  putative Na+/phosphate symporter  37.16 
 
 
578 aa  256  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337065  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0969  Na+/Pi-cotransporter family protein  32.67 
 
 
562 aa  254  3e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0614993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.31 
 
 
566 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  32.57 
 
 
535 aa  249  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.22 
 
 
563 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.46 
 
 
556 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5541  hypothetical protein  40.33 
 
 
555 aa  216  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  27.5 
 
 
537 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63750  hypothetical protein  40 
 
 
555 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197236  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.53 
 
 
558 aa  213  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  27.69 
 
 
537 aa  212  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.45 
 
 
536 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.56 
 
 
565 aa  206  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.29 
 
 
643 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.3 
 
 
538 aa  193  6e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.05 
 
 
541 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.86 
 
 
541 aa  181  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  25.46 
 
 
551 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  25.46 
 
 
551 aa  179  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.67 
 
 
541 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.24 
 
 
541 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.46 
 
 
551 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  25.28 
 
 
551 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  25.28 
 
 
551 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1734  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.05 
 
 
564 aa  177  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  27.81 
 
 
559 aa  177  6e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  25.28 
 
 
544 aa  176  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  25.28 
 
 
551 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  25.28 
 
 
551 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  25.28 
 
 
551 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  25.09 
 
 
551 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>