More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0489 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 
666 aa  1360  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4334  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.49 
 
 
645 aa  643  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969348  decreased coverage  0.00494377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2884  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.33 
 
 
646 aa  635  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2387  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.38 
 
 
655 aa  638  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  85.2 
 
 
664 aa  1140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.16 
 
 
660 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.16 
 
 
660 aa  625  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.3 
 
 
678 aa  615  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2864  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.77 
 
 
678 aa  607  1e-172  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2956  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.77 
 
 
678 aa  604  1e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2789  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  49.62 
 
 
670 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1247  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.53 
 
 
676 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.465909  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4478  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  46.83 
 
 
666 aa  563  1e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.48246  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5318  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  44.93 
 
 
657 aa  496  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4315  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.2 
 
 
658 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2388  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.17 
 
 
627 aa  400  1e-110  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.92 
 
 
634 aa  399  1e-110  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3403  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.9 
 
 
624 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3533  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.39 
 
 
621 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.25 
 
 
643 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.79 
 
 
639 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.85 
 
 
637 aa  368  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0669  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.41 
 
 
641 aa  365  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2519  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.68 
 
 
647 aa  363  6e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.828783  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2408  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.74 
 
 
635 aa  358  2e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0777  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.64 
 
 
670 aa  357  4e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.159884  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.26 
 
 
628 aa  357  5e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  37.8 
 
 
643 aa  357  5e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.2 
 
 
625 aa  356  7e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.71 
 
 
635 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7772  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.87 
 
 
654 aa  350  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.11 
 
 
632 aa  350  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  2.88023e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3121  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.94 
 
 
641 aa  347  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.8 
 
 
625 aa  344  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0138  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.44 
 
 
631 aa  344  3e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0809158  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.06 
 
 
629 aa  340  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.45 
 
 
633 aa  340  7e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.26358e-07  unclonable  6.28543e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.78 
 
 
633 aa  340  7e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.33092e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.28 
 
 
633 aa  338  2e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  33.28 
 
 
633 aa  338  2e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.00713e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.28 
 
 
633 aa  338  2e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.60892e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.28 
 
 
633 aa  338  2e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  33.28 
 
 
633 aa  338  2e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.74005e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.28 
 
 
633 aa  338  2e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  7.47097e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.28 
 
 
633 aa  338  2e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.07333e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3272  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  34.63 
 
 
642 aa  338  2e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.5 
 
 
633 aa  335  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.97095e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.3 
 
 
633 aa  334  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.96 
 
 
638 aa  333  8e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.9 
 
 
629 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0185  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.78 
 
 
670 aa  332  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3705  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.74 
 
 
647 aa  331  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.69 
 
 
605 aa  330  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.28708e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.17 
 
 
646 aa  328  1e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0032  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.95 
 
 
672 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.579611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3874  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.62 
 
 
632 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.68 
 
 
619 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.65 
 
 
592 aa  321  2e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1919  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.38 
 
 
631 aa  320  4e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0712  putative asparagine synthetase  34 
 
 
626 aa  320  4e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.57 
 
 
632 aa  320  7e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4439  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.84 
 
 
634 aa  318  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11980  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.42 
 
 
649 aa  318  2e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.658522  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.53 
 
 
634 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2327  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.44 
 
 
629 aa  315  2e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.752356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0793  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.9 
 
 
639 aa  313  5e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.716028 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  32.59 
 
 
632 aa  312  1e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2533  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.89 
 
 
625 aa  312  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.33 
 
 
619 aa  311  3e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  32.59 
 
 
632 aa  310  5e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0508  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.66 
 
 
626 aa  310  7e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0358  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.07 
 
 
697 aa  308  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.395531 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0474  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.88 
 
 
628 aa  306  7e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.26 
 
 
629 aa  306  7e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.73 
 
 
593 aa  305  1e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0254  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.03 
 
 
622 aa  305  2e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.69 
 
 
633 aa  305  2e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641496  normal  0.029694 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.39 
 
 
627 aa  305  2e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1110  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.45 
 
 
637 aa  304  4e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0961  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  32.36 
 
 
630 aa  303  7e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1938  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.53 
 
 
639 aa  303  7e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  31.3 
 
 
637 aa  302  1e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0596  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.28 
 
 
630 aa  298  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1989  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.84 
 
 
591 aa  297  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2339  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.63 
 
 
639 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.795917  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.44 
 
 
610 aa  295  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1756  asparagine synthase family amidotransferase  34.75 
 
 
594 aa  296  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.72 
 
 
606 aa  295  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.28 
 
 
610 aa  294  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2633  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  30.81 
 
 
674 aa  294  4e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.718376 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.92 
 
 
602 aa  294  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2057  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.15 
 
 
603 aa  294  4e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.825399  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0461  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.04 
 
 
613 aa  293  5e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3751  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.28 
 
 
655 aa  293  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0742  asparagine synthase family amidotransferase  33.76 
 
 
592 aa  290  5e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0858  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.63 
 
 
655 aa  290  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4217  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.17 
 
 
655 aa  287  3e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4843  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.42 
 
 
656 aa  288  3e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0921814  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3523  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.42 
 
 
656 aa  288  3e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.848758  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4005  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.7 
 
 
622 aa  288  3e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>