More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0087 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  80.84 
 
 		 453 aa  723    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 454 aa  904    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  49.78 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  46.37 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  37.53 
 
 		 451 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  34.08 
 
 		 428 aa  269  7e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  35.49 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.48 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  37.5 
 
 		 431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  38.25 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  31.11 
 
 		 441 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  31.78 
 
 		 441 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  34.29 
 
 		 443 aa  260  4e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  38.23 
 
 		 440 aa  257  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  34 
 
 		 424 aa  256  7e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  34.52 
 
 		 429 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  32.96 
 
 		 433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  37.3 
 
 		 439 aa  254  3e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  35.46 
 
 		 434 aa  252  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  34.15 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  37.9 
 
 		 437 aa  250  4e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.02 
 
 		 433 aa  250  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  32.78 
 
 		 433 aa  249  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  34.35 
 
 		 433 aa  249  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  34.73 
 
 		 431 aa  249  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  32.78 
 
 		 433 aa  249  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.02 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.78 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.02 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  32.78 
 
 		 433 aa  247  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  32.78 
 
 		 433 aa  247  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  32.78 
 
 		 433 aa  247  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  40.09 
 
 		 437 aa  246  6e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  34.29 
 
 		 427 aa  245  9e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  35.08 
 
 		 431 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.26 
 
 		 466 aa  243  7e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  37.53 
 
 		 457 aa  242  9e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  33.11 
 
 		 432 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.6 
 
 		 427 aa  239  9e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  32.78 
 
 		 413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  33.91 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  38.36 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  33.48 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  39.33 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  34.91 
 
 		 428 aa  230  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  38.98 
 
 		 424 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  34.13 
 
 		 416 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  32.82 
 
 		 435 aa  225  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  32.82 
 
 		 437 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  40.22 
 
 		 424 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  31.11 
 
 		 424 aa  223  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  32.52 
 
 		 437 aa  221  3e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  32.09 
 
 		 428 aa  219  8.999999999999998e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0591  FolC bifunctional protein  33.06 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  36.75 
 
 		 813 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  39.01 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  34.95 
 
 		 422 aa  211  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  38.42 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  37.97 
 
 		 442 aa  210  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  35.76 
 
 		 817 aa  209  8e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  28.35 
 
 		 438 aa  209  9e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  36.24 
 
 		 810 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  30.82 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  32.89 
 
 		 465 aa  207  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  36.87 
 
 		 463 aa  206  6e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  34.22 
 
 		 433 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0918  FolC bifunctional protein  38.44 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  33.77 
 
 		 840 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  36.24 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1754  FolC bifunctional protein  32.4 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.686494  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  39.39 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1720  FolC bifunctional protein  32.4 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  31.46 
 
 		 407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  30.47 
 
 		 408 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  35.19 
 
 		 452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  33.88 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  35.56 
 
 		 878 aa  195  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  31.93 
 
 		 429 aa  196  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  33.48 
 
 		 429 aa  195  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  35.21 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  33.4 
 
 		 847 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  29.48 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  37.91 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2877  folylpolyglutamate synthetase  36.36 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.971694 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  35.85 
 
 		 441 aa  189  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1227  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31 
 
 		 421 aa  189  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113059  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  35.85 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4405  FolC bifunctional protein  36.41 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  34.28 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3566  FolC bifunctional protein  36.41 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3962  FolC bifunctional protein  36.41 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  36.09 
 
 		 381 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1117  folylpolyglutamate synthase  29.65 
 
 		 420 aa  188  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  34.79 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  29.05 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  34.25 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2121  folylpolyglutamate synthetase  36.32 
 
 		 436 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700041  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  37.64 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4618  FolC bifunctional protein  36.56 
 
 		 436 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>