More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2951 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.07 
 
 
741 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.76 
 
 
733 aa  657    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1934  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.81 
 
 
743 aa  909    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.23 
 
 
739 aa  930    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  80 
 
 
723 aa  1168    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0229678 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1505  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.76 
 
 
743 aa  879    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.244217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.58 
 
 
759 aa  714    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0837  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.81 
 
 
740 aa  937    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41714  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0011  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.35 
 
 
741 aa  860    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.86 
 
 
739 aa  635    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2665  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.65 
 
 
727 aa  794    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.73 
 
 
742 aa  638    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.43 
 
 
739 aa  640    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1308  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.23 
 
 
737 aa  877    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1786  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.13 
 
 
736 aa  874    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2951  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 
746 aa  1508    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2144  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.61 
 
 
744 aa  908    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.470328  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.11 
 
 
737 aa  883    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.04 
 
 
737 aa  637    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.15 
 
 
761 aa  686    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.49 
 
 
740 aa  833    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.65 
 
 
759 aa  719    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.68 
 
 
736 aa  874    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.755949  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.63 
 
 
719 aa  822    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3455  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.38 
 
 
737 aa  793    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821031  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2389  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.96 
 
 
740 aa  928    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2173  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  78.41 
 
 
719 aa  1125    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.64 
 
 
736 aa  873    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  99.32 
 
 
740 aa  1487    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.122735 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.36 
 
 
736 aa  849    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0185  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  57.36 
 
 
737 aa  752    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.310724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1752  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.89 
 
 
736 aa  892    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.12 
 
 
744 aa  889    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.29 
 
 
739 aa  635    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.97 
 
 
768 aa  661    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409731  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1118  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  78.33 
 
 
721 aa  1101    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2197  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.68 
 
 
747 aa  838    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.541923 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.29 
 
 
739 aa  635    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  68.19 
 
 
744 aa  929    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.06 
 
 
737 aa  884    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.19 
 
 
735 aa  879    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.59 
 
 
724 aa  873    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.81 
 
 
740 aa  937    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.67 
 
 
741 aa  833    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0894  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  93.32 
 
 
719 aa  1331    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.139167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1127  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.87 
 
 
741 aa  835    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.75 
 
 
749 aa  849    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3971  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  84.12 
 
 
723 aa  1191    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0012  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.35 
 
 
741 aa  860    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160482  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.75 
 
 
735 aa  921    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0010  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.78 
 
 
741 aa  852    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.6 
 
 
745 aa  914    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.11 
 
 
767 aa  709    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.51 
 
 
759 aa  722    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.17 
 
 
737 aa  895    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.15 
 
 
739 aa  634  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.15 
 
 
739 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.15 
 
 
739 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.15 
 
 
739 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.88 
 
 
742 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.01 
 
 
739 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.09 
 
 
744 aa  634  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.67 
 
 
733 aa  632  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.01 
 
 
739 aa  631  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.01 
 
 
739 aa  631  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1129  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.11 
 
 
729 aa  621  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1151  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.11 
 
 
729 aa  621  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.16 
 
 
729 aa  610  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.49 
 
 
733 aa  605  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.9 
 
 
761 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.75 
 
 
739 aa  604  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.81 
 
 
761 aa  600  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1205  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.38 
 
 
770 aa  598  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.737255  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.28 
 
 
760 aa  596  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377491  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1035  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.6 
 
 
728 aa  592  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1310  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.38 
 
 
760 aa  592  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.831791  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0826  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.33 
 
 
728 aa  592  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1663  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.78 
 
 
750 aa  591  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.57 
 
 
733 aa  591  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0978  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.6 
 
 
728 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.74135  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.8 
 
 
758 aa  586  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0667  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.13 
 
 
732 aa  587  1e-166  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.629797  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.9 
 
 
761 aa  586  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.21 
 
 
758 aa  588  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2298  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.13 
 
 
734 aa  587  1e-166  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.032092 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.48 
 
 
725 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0556  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.07 
 
 
731 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.624203  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.33 
 
 
752 aa  581  1e-164  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.6 
 
 
777 aa  580  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1835  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.15 
 
 
729 aa  582  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.17 
 
 
738 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.72 
 
 
764 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.91 
 
 
736 aa  570  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1330  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.03 
 
 
803 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.89 
 
 
803 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2274  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.5 
 
 
754 aa  565  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00429114  normal  0.210249 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.62 
 
 
767 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.85 
 
 
765 aa  565  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.49 
 
 
802 aa  560  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.4 
 
 
767 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>