More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3930 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_3930  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
283 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.922755  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1289  phospholipid/glycerol acyltransferase  85.87 
 
 
282 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4813  phospholipid/glycerol acyltransferase  74.47 
 
 
282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4127  phospholipid/glycerol acyltransferase  73.36 
 
 
291 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1819  phospholipid/glycerol acyltransferase  55.02 
 
 
271 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0759  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.43 
 
 
267 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2152  acyltransferase, putative  49.61 
 
 
267 aa  248  7e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2065  putative acyltransferase  50.41 
 
 
254 aa  243  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0020  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.2 
 
 
265 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.398753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0039  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.78 
 
 
289 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000361849 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0698  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.08 
 
 
260 aa  218  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0436  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  42 
 
 
265 aa  218  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0032  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.8 
 
 
265 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3918  lyso-ornithine lipid acyltransferase  44.4 
 
 
262 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.599966  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3525  phospholipid/glycerol acyltransferase  51.71 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337156  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3201  phospholipid/glycerol acyltransferase  51.71 
 
 
292 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.777039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3616  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.22 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3397  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.76 
 
 
292 aa  205  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4432  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.61 
 
 
291 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3391  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.46 
 
 
298 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0641  phospholipid/glycerol acyltransferase  51.96 
 
 
288 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503338  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3769  lyso-ornithine lipid acyltransferase  40.08 
 
 
319 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.158826  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1352  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.9 
 
 
270 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0794146  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1179  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.39 
 
 
312 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307863  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1653  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.84 
 
 
276 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1209  lyso-ornithine lipid acyltransferase  35.41 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.985535  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3630  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.13 
 
 
252 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3808  hypothetical protein  38.64 
 
 
287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.164896  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4507  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.82 
 
 
277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1851  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.26 
 
 
288 aa  119  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.296595  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1473  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.54 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0297891  normal  0.0549508 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2435  lyso-ornithine lipid acyltransferase  35 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.52219  normal  0.0144042 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0695  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.57 
 
 
262 aa  116  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2386  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.51 
 
 
241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1992  acyltransferase family protein  36.65 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.60533  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2751  acyltransferase family protein  36.65 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3165  acyltransferase family protein  36.65 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0921  acyltransferase domain-containing protein  36.65 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1854  acyltransferase domain-containing protein  36.65 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3143  acyltransferase domain-containing protein  36.65 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3520  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.64 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.808003  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2735  lyso-ornithine lipid acyltransferase  37.86 
 
 
256 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3827  lyso-ornithine lipid acyltransferase  36.21 
 
 
246 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1467  acyltransferase domain-containing protein  37.63 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3107  acyltransferase domain-containing protein  37.14 
 
 
289 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0207  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.76 
 
 
225 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6048  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.13 
 
 
330 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0058  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  32.64 
 
 
255 aa  105  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1584  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.62 
 
 
255 aa  105  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3453  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.52 
 
 
277 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.347441  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0840  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.47 
 
 
285 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90498  hitchhiker  0.00272308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3806  lyso-ornithine lipid acyltransferase  31.03 
 
 
292 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1147  lyso-ornithine lipid acyltransferase  30.91 
 
 
245 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0387  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.47 
 
 
285 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0869  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.47 
 
 
285 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.788185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56570  putative acyltransferase  32.42 
 
 
258 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.501809  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4612  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.56 
 
 
248 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0710  lyso-ornithine lipid acyltransferase  32.22 
 
 
273 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3967  lyso-ornithine lipid acyltransferase  34.48 
 
 
285 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.930153  normal  0.606855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4923  putative acyltransferase  33.33 
 
 
258 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0875  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.35 
 
 
281 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.595723 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1139  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.3 
 
 
258 aa  101  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0742  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.93 
 
 
285 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0759  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.75 
 
 
285 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2738  lyso-ornithine lipid acyltransferase  31.02 
 
 
278 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.86 
 
 
253 aa  99.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2519  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.6 
 
 
285 aa  99  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0572  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.81 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2322  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.84 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12693 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0468  lyso-ornithine lipid acyltransferase  28.65 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0186334  normal  0.735375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0983  lyso-ornithine lipid acyltransferase  30.3 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283348  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3957  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.47 
 
 
241 aa  96.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00230102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0912  lyso-ornithine lipid acyltransferase  32.24 
 
 
245 aa  96.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.427202 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0103  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.12 
 
 
263 aa  95.9  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0143451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1286  lyso-ornithine lipid acyltransferase  31.38 
 
 
264 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0680  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase transmembrane protein  33.03 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1583  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.88 
 
 
249 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.867184 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2037  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.62 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4354  acyltransferase domain protein  32.45 
 
 
268 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0624  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.25 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4049  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.45 
 
 
264 aa  92  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0397  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.65 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3343  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  32 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0189136  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0356  lyso-ornithine lipid acyltransferase  30.65 
 
 
266 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3933  lyso-ornithine lipid acyltransferase  32.64 
 
 
232 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03575  acetyltransferase  38.13 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.242571  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2065  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.06 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.572898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1854  lyso-ornithine lipid acyltransferase  34.53 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0169  lyso-ornithine lipid acyltransferase  30.21 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0915233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0989  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.76 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1874  lyso-ornithine lipid acyltransferase  34.53 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1920  lyso-ornithine lipid acyltransferase  34.53 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141545  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1899  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.86 
 
 
259 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0710  lyso-ornithine lipid acyltransferase  33.67 
 
 
249 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4465  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.85 
 
 
262 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.0348666 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1866  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.57 
 
 
290 aa  87  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0653841  normal  0.746167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2323  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.42 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2891  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.67 
 
 
246 aa  86.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3568  lyso-ornithine lipid acyltransferase  31.67 
 
 
246 aa  86.3  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1125  lyso-ornithine lipid acyltransferase  34.43 
 
 
257 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.801082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>