More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2738 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2738  lyso-ornithine lipid acyltransferase  100 
 
 
278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0710  lyso-ornithine lipid acyltransferase  73.86 
 
 
273 aa  367  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0680  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase transmembrane protein  52.89 
 
 
266 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0572  phospholipid/glycerol acyltransferase  51.65 
 
 
265 aa  261  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0624  phospholipid/glycerol acyltransferase  51.04 
 
 
265 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3806  lyso-ornithine lipid acyltransferase  49.36 
 
 
292 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0875  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.1 
 
 
281 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.595723 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2322  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.14 
 
 
283 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12693 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1854  acyltransferase domain-containing protein  46.22 
 
 
289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1992  acyltransferase family protein  46.22 
 
 
289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.60533  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0921  acyltransferase domain-containing protein  46.22 
 
 
289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3165  acyltransferase family protein  46.22 
 
 
289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3143  acyltransferase domain-containing protein  46.22 
 
 
289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2751  acyltransferase family protein  46.22 
 
 
289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3107  acyltransferase domain-containing protein  46.38 
 
 
289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0840  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.22 
 
 
285 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90498  hitchhiker  0.00272308 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0387  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.22 
 
 
285 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0869  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.22 
 
 
285 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.788185  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3967  lyso-ornithine lipid acyltransferase  46.3 
 
 
285 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.930153  normal  0.606855 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0742  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.8 
 
 
285 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2519  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.83 
 
 
285 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0759  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.37 
 
 
285 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4612  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.83 
 
 
248 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1147  lyso-ornithine lipid acyltransferase  43.16 
 
 
245 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0912  lyso-ornithine lipid acyltransferase  43.88 
 
 
245 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.427202 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1467  acyltransferase domain-containing protein  43.14 
 
 
273 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3568  lyso-ornithine lipid acyltransferase  40.59 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2891  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.93 
 
 
246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0468  lyso-ornithine lipid acyltransferase  40 
 
 
259 aa  183  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0186334  normal  0.735375 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0169  lyso-ornithine lipid acyltransferase  42.44 
 
 
273 aa  178  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0915233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.72 
 
 
253 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1512  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.35 
 
 
252 aa  176  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0808904  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3453  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.35 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.347441  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3343  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  39.24 
 
 
245 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0189136  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1583  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.5 
 
 
249 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.867184 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0207  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.2 
 
 
225 aa  169  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3957  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.74 
 
 
241 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00230102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0710  lyso-ornithine lipid acyltransferase  40 
 
 
249 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1584  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.25 
 
 
255 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3933  lyso-ornithine lipid acyltransferase  42.86 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1080  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.85 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2735  lyso-ornithine lipid acyltransferase  37.62 
 
 
256 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0058  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  37.5 
 
 
255 aa  132  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0727  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.79 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0875  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.79 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342113  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6048  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56570  putative acyltransferase  34.67 
 
 
258 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.501809  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03575  acetyltransferase  34.76 
 
 
243 aa  122  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.242571  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4923  putative acyltransferase  33.65 
 
 
258 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3918  lyso-ornithine lipid acyltransferase  35.78 
 
 
262 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.599966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4049  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.98 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4354  acyltransferase domain protein  32.11 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0103  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.64 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0143451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0989  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.61 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209511 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1899  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.75 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1125  lyso-ornithine lipid acyltransferase  32.88 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.801082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2323  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.67 
 
 
272 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4432  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.89 
 
 
291 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281361  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1867  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.72 
 
 
272 aa  113  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603532  normal  0.936016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37770  Phospholipid/glycerol acyltransferase protein  38.56 
 
 
256 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0356  lyso-ornithine lipid acyltransferase  33.52 
 
 
266 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4465  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.96 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.0348666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1289  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.6 
 
 
282 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0397  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.97 
 
 
266 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1819  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.89 
 
 
271 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1286  lyso-ornithine lipid acyltransferase  41.79 
 
 
264 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0436  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.35 
 
 
265 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3391  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.84 
 
 
298 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1866  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.78 
 
 
290 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0653841  normal  0.746167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0923  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.39 
 
 
262 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2152  acyltransferase, putative  35.71 
 
 
267 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0698  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.58 
 
 
260 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0020  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.33 
 
 
265 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.398753 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2065  putative acyltransferase  35.71 
 
 
254 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0962  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.39 
 
 
262 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56375  normal  0.0837796 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0641  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.42 
 
 
288 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503338  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3525  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.6 
 
 
292 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337156  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3201  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.67 
 
 
292 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.777039 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4127  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.86 
 
 
291 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0502  lyso-ornithine lipid acyltransferase  32.43 
 
 
287 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0032  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
265 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4813  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.92 
 
 
282 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3397  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.32 
 
 
292 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2435  lyso-ornithine lipid acyltransferase  35.83 
 
 
278 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.52219  normal  0.0144042 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1209  lyso-ornithine lipid acyltransferase  32.67 
 
 
286 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.985535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4256  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.46 
 
 
286 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1122  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.57 
 
 
256 aa  99.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.989622  normal  0.329489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3930  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.84 
 
 
283 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.922755  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0039  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.62 
 
 
289 aa  99.4  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000361849 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2065  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.3 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.572898 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0983  lyso-ornithine lipid acyltransferase  31.9 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283348  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1851  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.97 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.296595  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1653  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.21 
 
 
276 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2037  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.67 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1441  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.71 
 
 
245 aa  95.9  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.520937  normal  0.685719 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3808  hypothetical protein  34.86 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.164896  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2386  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.69 
 
 
241 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2104  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.39 
 
 
294 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3520  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.47 
 
 
274 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.808003  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0759  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.68 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>