More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0680 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0680  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase transmembrane protein  100 
 
 		 266 aa  534  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0572  phospholipid/glycerol acyltransferase  77.82 
 
 		 265 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0624  phospholipid/glycerol acyltransferase  76.32 
 
 		 265 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2738  lyso-ornithine lipid acyltransferase  52.72 
 
 		 278 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0710  lyso-ornithine lipid acyltransferase  52.1 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0742  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.28 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0840  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.78 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90498  hitchhiker  0.00272308 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0387  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.37 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0869  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.37 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.788185  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2519  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.03 
 
 		 285 aa  221  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0875  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.96 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.595723 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0759  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.89 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3806  lyso-ornithine lipid acyltransferase  47.58 
 
 		 292 aa  218  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1992  acyltransferase family protein  45 
 
 		 289 aa  214  8e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.60533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3165  acyltransferase family protein  45 
 
 		 289 aa  214  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2751  acyltransferase family protein  45 
 
 		 289 aa  214  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0921  acyltransferase domain-containing protein  45 
 
 		 289 aa  214  8e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3143  acyltransferase domain-containing protein  45 
 
 		 289 aa  214  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1854  acyltransferase domain-containing protein  45 
 
 		 289 aa  214  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2322  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.49 
 
 		 283 aa  214  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12693 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3107  acyltransferase domain-containing protein  44.81 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3967  lyso-ornithine lipid acyltransferase  45.78 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.930153  normal  0.606855 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1467  acyltransferase domain-containing protein  44.5 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1584  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.18 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4612  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.3 
 
 		 248 aa  181  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0468  lyso-ornithine lipid acyltransferase  37.82 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0186334  normal  0.735375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1512  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.4 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0808904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3343  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  40.42 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0189136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0912  lyso-ornithine lipid acyltransferase  44.21 
 
 		 245 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427202 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0169  lyso-ornithine lipid acyltransferase  42.06 
 
 		 273 aa  175  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0915233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1583  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.81 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.867184 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2891  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.75 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3568  lyso-ornithine lipid acyltransferase  39.34 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3453  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.08 
 
 		 277 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.347441  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1147  lyso-ornithine lipid acyltransferase  38.82 
 
 		 245 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.29 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0710  lyso-ornithine lipid acyltransferase  41.07 
 
 		 249 aa  159  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0207  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.75 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3957  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.25 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00230102 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1080  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.07 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4256  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.05 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1854  lyso-ornithine lipid acyltransferase  34.77 
 
 		 278 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6048  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.43 
 
 		 330 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3933  lyso-ornithine lipid acyltransferase  38.42 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1874  lyso-ornithine lipid acyltransferase  34.77 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1920  lyso-ornithine lipid acyltransferase  34.77 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141545  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0727  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.92 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0875  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.92 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2735  lyso-ornithine lipid acyltransferase  41.86 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2104  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.62 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0058  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  33.47 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0103  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.76 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0143451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4049  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.17 
 
 		 264 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4923  putative acyltransferase  34.91 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4354  acyltransferase domain protein  32.67 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1899  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.48 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56570  putative acyltransferase  34.91 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.501809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03575  acetyltransferase  33.33 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.242571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0502  lyso-ornithine lipid acyltransferase  37.71 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1286  lyso-ornithine lipid acyltransferase  34.13 
 
 		 264 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3257  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.76 
 
 		 298 aa  108  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2323  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.29 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13042  hypothetical protein  32.31 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000661258  hitchhiker  0.00356803 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0356  lyso-ornithine lipid acyltransferase  31.38 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4465  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.14 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.0348666 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0397  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.38 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0989  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.98 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1122  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.41 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.989622  normal  0.329489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1125  lyso-ornithine lipid acyltransferase  30 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.801082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0923  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.11 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0962  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.11 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56375  normal  0.0837796 
 
 
-
 
NC_004310  BR2152  acyltransferase, putative  33.48 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2065  putative acyltransferase  33.48 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3918  lyso-ornithine lipid acyltransferase  32.49 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.599966  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1867  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.69 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603532  normal  0.936016 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3630  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.09 
 
 		 252 aa  99.8  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37770  Phospholipid/glycerol acyltransferase protein  36.11 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4065  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.19 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.454479  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0039  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.05 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000361849 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1209  lyso-ornithine lipid acyltransferase  33.33 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.985535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2435  lyso-ornithine lipid acyltransferase  35.05 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.52219  normal  0.0144042 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1139  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.84 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2386  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.95 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0759  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.02 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1653  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.86 
 
 		 276 aa  95.9  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3930  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.03 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.922755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1866  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.48 
 
 		 290 aa  95.5  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0653841  normal  0.746167 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2037  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.84 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3808  hypothetical protein  37.24 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4127  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.91 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3520  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.24 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.808003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4432  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.76 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281361  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0032  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.05 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1819  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.34 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0695  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.53 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0698  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.43 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2065  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.83 
 
 		 261 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.572898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3391  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.01 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1473  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.29 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0297891  normal  0.0549508 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3201  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.28 
 
 		 292 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.777039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>