More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3957 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3957  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
241 aa  477  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00230102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0710  lyso-ornithine lipid acyltransferase  59.58 
 
 
249 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4612  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.12 
 
 
248 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1147  lyso-ornithine lipid acyltransferase  48.29 
 
 
245 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1512  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.46 
 
 
252 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0808904  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3343  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  46.96 
 
 
245 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0189136  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1583  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.51 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.867184 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0912  lyso-ornithine lipid acyltransferase  47.23 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.427202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2738  lyso-ornithine lipid acyltransferase  42.74 
 
 
278 aa  178  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.28 
 
 
253 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2891  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.81 
 
 
246 aa  176  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3568  lyso-ornithine lipid acyltransferase  45.81 
 
 
246 aa  174  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0875  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.42 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.595723 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0468  lyso-ornithine lipid acyltransferase  38.75 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0186334  normal  0.735375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3806  lyso-ornithine lipid acyltransferase  42.42 
 
 
292 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0710  lyso-ornithine lipid acyltransferase  43.5 
 
 
273 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0742  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.84 
 
 
285 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0624  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.66 
 
 
265 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0840  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.44 
 
 
285 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90498  hitchhiker  0.00272308 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0387  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.44 
 
 
285 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0869  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.44 
 
 
285 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.788185  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0572  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.91 
 
 
265 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0759  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.67 
 
 
285 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541169 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2519  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.86 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0680  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase transmembrane protein  40.25 
 
 
266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3967  lyso-ornithine lipid acyltransferase  43.11 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.930153  normal  0.606855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2322  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.28 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12693 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1992  acyltransferase family protein  41.49 
 
 
289 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.60533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3165  acyltransferase family protein  41.49 
 
 
289 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2751  acyltransferase family protein  41.49 
 
 
289 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0921  acyltransferase domain-containing protein  41.49 
 
 
289 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3143  acyltransferase domain-containing protein  41.49 
 
 
289 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1854  acyltransferase domain-containing protein  41.49 
 
 
289 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3107  acyltransferase domain-containing protein  41.42 
 
 
289 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3453  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.48 
 
 
277 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.347441  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0207  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.26 
 
 
225 aa  149  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1467  acyltransferase domain-containing protein  44.07 
 
 
273 aa  141  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1584  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.18 
 
 
255 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0727  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.48 
 
 
299 aa  136  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0875  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.48 
 
 
300 aa  136  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342113  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4354  acyltransferase domain protein  41.36 
 
 
268 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4049  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.36 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0169  lyso-ornithine lipid acyltransferase  39.51 
 
 
273 aa  134  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0915233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56570  putative acyltransferase  39.91 
 
 
258 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.501809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4923  putative acyltransferase  38.24 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1080  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.12 
 
 
246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1899  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.55 
 
 
259 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0356  lyso-ornithine lipid acyltransferase  37.16 
 
 
266 aa  123  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1867  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.53 
 
 
272 aa  122  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603532  normal  0.936016 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0397  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.49 
 
 
266 aa  121  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6048  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.65 
 
 
330 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2735  lyso-ornithine lipid acyltransferase  39.69 
 
 
256 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0103  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.35 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0143451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0502  lyso-ornithine lipid acyltransferase  37.89 
 
 
287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3933  lyso-ornithine lipid acyltransferase  38.66 
 
 
232 aa  118  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4065  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.11 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.454479  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37770  Phospholipid/glycerol acyltransferase protein  39.06 
 
 
256 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1122  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.96 
 
 
256 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.989622  normal  0.329489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2104  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.41 
 
 
294 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1286  lyso-ornithine lipid acyltransferase  37.7 
 
 
264 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0058  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  38.99 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1125  lyso-ornithine lipid acyltransferase  39.41 
 
 
257 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.801082 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03575  acetyltransferase  41.26 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.242571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4256  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.9 
 
 
286 aa  108  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1920  lyso-ornithine lipid acyltransferase  40.1 
 
 
278 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141545  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1854  lyso-ornithine lipid acyltransferase  40.1 
 
 
278 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1874  lyso-ornithine lipid acyltransferase  40.1 
 
 
278 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1866  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.26 
 
 
290 aa  106  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0653841  normal  0.746167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4465  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.04 
 
 
262 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.0348666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0962  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.51 
 
 
262 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56375  normal  0.0837796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0923  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.51 
 
 
262 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0695  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.29 
 
 
262 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2323  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.79 
 
 
272 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0989  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.42 
 
 
262 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2037  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.2 
 
 
255 aa  102  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2152  acyltransferase, putative  33.49 
 
 
267 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2065  putative acyltransferase  33.49 
 
 
254 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3930  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.41 
 
 
283 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.922755  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3918  lyso-ornithine lipid acyltransferase  35.16 
 
 
262 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.599966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2386  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.66 
 
 
241 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0039  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.94 
 
 
289 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000361849 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0698  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.8 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3630  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.16 
 
 
252 aa  98.6  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13042  hypothetical protein  36.92 
 
 
304 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000661258  hitchhiker  0.00356803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3525  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.87 
 
 
292 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.337156  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3201  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.87 
 
 
292 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.777039 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2065  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.49 
 
 
261 aa  95.5  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.572898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0641  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.25 
 
 
288 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503338  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3257  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.32 
 
 
298 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1653  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.99 
 
 
276 aa  94.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1441  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.62 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.520937  normal  0.685719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1289  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.17 
 
 
282 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1139  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.49 
 
 
258 aa  93.2  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4127  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.89 
 
 
291 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0436  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.22 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1851  phospholipid/glycerol acyltransferase  35 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.296595  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0759  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.1 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1209  lyso-ornithine lipid acyltransferase  33.67 
 
 
286 aa  90.5  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.985535  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3391  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.5 
 
 
298 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1352  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.36 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0794146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>