218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1754 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1754  arginine/ornithine transport system ATPase  100 
 
 		 331 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  83.08 
 
 		 330 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  82.77 
 
 		 330 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  82.5 
 
 		 329 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  77.04 
 
 		 330 aa  518  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2240  arginine/ornithine transport system ATPase  76.78 
 
 		 326 aa  497  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0574886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2640  arginine/ornithine transport system ATPase  78.95 
 
 		 326 aa  494  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  67.21 
 
 		 328 aa  418  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  65.14 
 
 		 346 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  64.83 
 
 		 329 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  64.63 
 
 		 328 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  64.56 
 
 		 329 aa  401  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  68.92 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  60.87 
 
 		 333 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2114  arginine/ornithine transport system ATPase  68.24 
 
 		 326 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00605272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  57.59 
 
 		 332 aa  361  9e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  57.14 
 
 		 331 aa  360  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1350  arginine/ornithine transport system ATPase  58.18 
 
 		 372 aa  359  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0354539  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  55.24 
 
 		 325 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  55.24 
 
 		 325 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  55.24 
 
 		 325 aa  358  8e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  57.41 
 
 		 347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2504  LAO/AO transport system ATPase  58.81 
 
 		 329 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000648266  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  56.47 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  56.92 
 
 		 332 aa  353  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  57.32 
 
 		 364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  57.99 
 
 		 332 aa  352  5e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6417  LAO/AO transport system ATPase  58.15 
 
 		 328 aa  352  5.9999999999999994e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  58.79 
 
 		 334 aa  350  3e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  54.8 
 
 		 343 aa  349  4e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3873  arginine/ornithine transport system ATPase  60.2 
 
 		 380 aa  349  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0439716  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  55.31 
 
 		 346 aa  348  5e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3189  arginine/ornithine transport system ATPase  59.09 
 
 		 322 aa  348  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  0.363793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0078  LAO/AO transport system ATPase  58.22 
 
 		 331 aa  344  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2106  LAO/AO transport system ATPase  56.11 
 
 		 330 aa  343  2.9999999999999997e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1173  LAO/AO transport system ATPase  54.87 
 
 		 329 aa  340  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0546  arginine/ornithine transport system ATPase  57.86 
 
 		 378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  55.8 
 
 		 329 aa  339  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  55.94 
 
 		 333 aa  338  7e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3259  LAO/AO transport system ATPase  55.63 
 
 		 322 aa  331  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00849768  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09151  arginine/ornithine transport system ATPase  49.69 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.471004  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3302  LAO/AO transport system ATPase  53.44 
 
 		 374 aa  325  7e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107074  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  55.38 
 
 		 372 aa  324  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  52.68 
 
 		 330 aa  323  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.436585 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5021  LAO/AO transport system ATPase  49.84 
 
 		 363 aa  323  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0197522  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0280  arginine/ornithine transport system ATPase  53.87 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1919  LAO/AO transport system ATPase  58.06 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal  0.437335 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1283  arginine/ornithine transport system ATPase  51.23 
 
 		 381 aa  318  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1322  arginine/ornithine transport system ATPase  56.77 
 
 		 351 aa  315  5e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.822906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2293  arginine/ornithine transport system ATPase  52.19 
 
 		 366 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000757851  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1015  arginine/ornithine transport system ATPase  52.85 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0321  arginine/ornithine transport system ATPase  48.1 
 
 		 343 aa  315  9.999999999999999e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.659399 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2804  arginine/ornithine transport system ATPase  53.09 
 
 		 352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2382  arginine/ornithine transport system ATPase  51.63 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0911  arginine/ornithine transport system ATPase  49.38 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3054  arginine/ornithine transport system ATPase  48.46 
 
 		 331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1850  arginine/ornithine transport system ATPase  52.8 
 
 		 342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02749  arginine/ornithine transport system ATPase  48.15 
 
 		 331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0775  LAO/AO transport system ATPase  48.15 
 
 		 331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02712  hypothetical protein  48.15 
 
 		 331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3076  arginine/ornithine transport system ATPase  48.15 
 
 		 331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2163  arginine/ornithine transport system ATPase  50.97 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191923  normal  0.423822 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0792  arginine/ornithine transport system ATPase  47.84 
 
 		 331 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3245  arginine/ornithine transport system ATPase  47.84 
 
 		 331 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4214  arginine/ornithine transport system ATPase  47.84 
 
 		 331 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2020  LAO/AO transport system ATPase  46.55 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526211 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0867  arginine/ornithine transport system ATPase  48.03 
 
 		 334 aa  301  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2695  arginine/ornithine transport system ATPase  50.77 
 
 		 351 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3340  arginine/ornithine transport system ATPase  47.53 
 
 		 331 aa  300  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3754  arginine/ornithine transport system ATPase  54.28 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402613  normal  0.550126 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3400  arginine/ornithine transport system ATPase  49.84 
 
 		 343 aa  298  8e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3543  LAO/AO transport system ATPase  51.62 
 
 		 328 aa  297  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.569209  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2041  arginine/ornithine transport system ATPase  53.67 
 
 		 321 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.749207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1237  arginine/ornithine transport system ATPase  46.42 
 
 		 336 aa  296  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1163  arginine/ornithine transport system ATPase  46.11 
 
 		 343 aa  294  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0511506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2129  arginine/ornithine transport system ATPase  50.97 
 
 		 350 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50019  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2512  arginine/ornithine transport system ATPase  51.7 
 
 		 340 aa  293  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0387  LAO/AO transport system ATPase  49.02 
 
 		 332 aa  292  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3946  LAO/AO transport system ATPase  47.35 
 
 		 337 aa  287  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1356  LAO/AO transport system ATPase  49.55 
 
 		 345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229963  normal  0.961808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1166  arginine/ornithine transport system ATPase  45.05 
 
 		 337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00541841  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1172  LAO/AO transport system ATPase  46.71 
 
 		 335 aa  281  8.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.978419  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1293  arginine/ornithine transport system ATPase  45.77 
 
 		 337 aa  278  9e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2582  arginine/ornithine transport system ATPase  50 
 
 		 358 aa  277  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575877  hitchhiker  0.000151333 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0931  arginine/ornithine transport system ATPase  48.3 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3457  arginine/ornithine transport system ATPase  50.5 
 
 		 303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2431  arginine/ornithine transport system ATPase  52.15 
 
 		 337 aa  269  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698067  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0670  arginine/ornithine transport system ATPase  53.26 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.160836  normal  0.268873 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0874  LAO/AO transport system ATPase  42.9 
 
 		 341 aa  265  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0562176  normal  0.0447783 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3113  arginine/ornithine transport system ATPase  49.52 
 
 		 323 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  hitchhiker  0.00331919 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2015  arginine/ornithine transport system ATPase  50.31 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.805467  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0725  arginine/ornithine transport system ATPase  50.31 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254962  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12878  predicted protein  39.39 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0496106  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  38.87 
 
 		 325 aa  192  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  37.69 
 
 		 312 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  41.6 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  37.72 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  41.31 
 
 		 356 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  41.89 
 
 		 345 aa  179  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  37.03 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>