241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1684 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.03 
 
 		 1009 aa  867    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  63.25 
 
 		 920 aa  1096    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.73 
 
 		 985 aa  911    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.86 
 
 		 994 aa  871    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3135  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.56 
 
 		 929 aa  721    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365231  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  58.08 
 
 		 918 aa  955    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.17 
 
 		 1030 aa  857    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.82 
 
 		 1006 aa  916    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  77.09 
 
 		 928 aa  1404    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.76 
 
 		 1085 aa  869    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.43 
 
 		 932 aa  812    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.24 
 
 		 1008 aa  872    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.73 
 
 		 949 aa  874    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.93 
 
 		 947 aa  858    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.25 
 
 		 998 aa  875    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.76 
 
 		 937 aa  933    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.92 
 
 		 1088 aa  868    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  77.3 
 
 		 933 aa  1443    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  78.6 
 
 		 928 aa  1441    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1714  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.52 
 
 		 957 aa  850    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.686661  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.76 
 
 		 949 aa  910    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 929 aa  1895    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.27 
 
 		 970 aa  868    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.6 
 
 		 994 aa  861    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  78.8 
 
 		 933 aa  1453    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  78.05 
 
 		 929 aa  1425    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.49 
 
 		 1009 aa  918    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3081  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.78 
 
 		 889 aa  736    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.134099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.03 
 
 		 994 aa  867    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.37 
 
 		 946 aa  759    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0841  Phosphoenolpyruvate carboxylase  49.73 
 
 		 939 aa  719    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  48.2 
 
 		 921 aa  755    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.05 
 
 		 1075 aa  856    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.66 
 
 		 998 aa  879    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.03 
 
 		 1009 aa  868    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.3 
 
 		 1002 aa  909    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  45.98 
 
 		 945 aa  726    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.37 
 
 		 946 aa  759    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.44 
 
 		 936 aa  723    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.47 
 
 		 950 aa  867    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.36 
 
 		 951 aa  894    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.94 
 
 		 982 aa  873    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.83 
 
 		 949 aa  876    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.86 
 
 		 994 aa  871    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.63 
 
 		 930 aa  874    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  51.14 
 
 		 923 aa  837    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.56 
 
 		 1004 aa  883    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  78.38 
 
 		 936 aa  1448    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.03 
 
 		 934 aa  864    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  66.85 
 
 		 926 aa  1162    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.86 
 
 		 994 aa  871    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.86 
 
 		 994 aa  871    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.86 
 
 		 1024 aa  870    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.37 
 
 		 946 aa  759    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.86 
 
 		 994 aa  871    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.05 
 
 		 937 aa  728    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.26 
 
 		 1001 aa  909    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0707  Phosphoenolpyruvate carboxylase  41.83 
 
 		 884 aa  662    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0759  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.45 
 
 		 931 aa  608  9.999999999999999e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  42.34 
 
 		 905 aa  606  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.68 
 
 		 929 aa  603  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.35 
 
 		 906 aa  600  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0760  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.42 
 
 		 940 aa  598  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1084  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.61 
 
 		 929 aa  581  1e-164  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.97 
 
 		 933 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.64 
 
 		 938 aa  573  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.2 
 
 		 952 aa  575  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.19 
 
 		 939 aa  571  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.08 
 
 		 931 aa  559  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.87 
 
 		 947 aa  544  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.95 
 
 		 957 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.46 
 
 		 914 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.39 
 
 		 929 aa  536  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.9 
 
 		 929 aa  539  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.9 
 
 		 929 aa  539  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.48 
 
 		 938 aa  532  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.72 
 
 		 928 aa  528  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.03 
 
 		 946 aa  529  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.68 
 
 		 972 aa  527  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.89 
 
 		 882 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3689  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.29 
 
 		 900 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.17 
 
 		 954 aa  505  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.62 
 
 		 940 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.58 
 
 		 937 aa  501  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.56 
 
 		 1038 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.57 
 
 		 945 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.03 
 
 		 896 aa  490  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.64 
 
 		 883 aa  492  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.89 
 
 		 1021 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.34 
 
 		 942 aa  486  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0248  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.8 
 
 		 887 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.5 
 
 		 932 aa  487  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.47 
 
 		 1023 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.05 
 
 		 898 aa  484  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0254  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.47 
 
 		 887 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.974753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1505  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.77 
 
 		 875 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4217  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.77 
 
 		 875 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638207  normal  0.736372 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.98 
 
 		 896 aa  479  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0304  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.18 
 
 		 931 aa  482  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1110  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.04 
 
 		 875 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>