29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1324 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1324  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  298  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00524213  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3898  hypothetical protein  84.51 
 
 		 144 aa  261  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4779  hypothetical protein  67.91 
 
 		 137 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.52313  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1128  hypothetical protein  43.48 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0166  hypothetical protein  43.86 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2404  hypothetical protein  36.67 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000403861  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1186  hypothetical protein  39.64 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2403  hypothetical protein  36.07 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000119394  hitchhiker  0.00120616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0585  hypothetical protein  37.5 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7652  hypothetical protein  36.21 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2672  hypothetical protein  35.96 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1573  hypothetical protein  32 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0760807  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1432  hypothetical protein  33.58 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0120  hypothetical protein  33.62 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00390  conserved hypothetical protein  28.78 
 
 		 287 aa  61.2  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5090  hypothetical protein  27.34 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1981  hypothetical protein  31.67 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0036  hypothetical protein  36.21 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1772  hypothetical protein  32 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4169  hypothetical protein  38.38 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0362  hypothetical protein  34.23 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0943  hypothetical protein  33.58 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2476  hypothetical protein  37.63 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00155227  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0035  hypothetical protein  30.6 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0711061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4253  hypothetical protein  33.08 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2822  conserved hypothetical secreted protein  32.17 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  32.1 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>