More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0025 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0025  glutaredoxin GrxC  100 
 
 
91 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0602  glutaredoxin 3  85.71 
 
 
91 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0106  glutaredoxin GrxC  85.39 
 
 
96 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0519  glutaredoxin GrxC  76.92 
 
 
113 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  74.71 
 
 
90 aa  138  2e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  59.76 
 
 
85 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  59.76 
 
 
85 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  58.54 
 
 
85 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  60.98 
 
 
93 aa  104  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  61.25 
 
 
85 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  56.79 
 
 
85 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  58.54 
 
 
85 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  58.54 
 
 
85 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  57.83 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  60.26 
 
 
88 aa  97.4  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  60.26 
 
 
88 aa  97.4  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  57.32 
 
 
85 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  54.32 
 
 
85 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  55.95 
 
 
88 aa  94  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  54.32 
 
 
88 aa  93.6  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  53.09 
 
 
85 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  60 
 
 
89 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  55.95 
 
 
88 aa  92.8  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  50.59 
 
 
85 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  49.4 
 
 
85 aa  90.5  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  52.44 
 
 
87 aa  89.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1464  glutaredoxin 3  53.57 
 
 
86 aa  90.1  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  53.01 
 
 
85 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  48.24 
 
 
86 aa  88.6  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  54.32 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  48.24 
 
 
86 aa  88.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  54.32 
 
 
85 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  54.88 
 
 
82 aa  87  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  54.88 
 
 
82 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  51.25 
 
 
88 aa  87.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  54.88 
 
 
82 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  54.32 
 
 
85 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  53.01 
 
 
84 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  53.75 
 
 
86 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4207  glutaredoxin 3  46.43 
 
 
86 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.720183 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  51.22 
 
 
87 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2777  glutaredoxin 3  49.41 
 
 
102 aa  85.5  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  49.41 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  52.5 
 
 
84 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  53.09 
 
 
85 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4078  glutaredoxin 3  46.43 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378056 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  51.19 
 
 
96 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  47.62 
 
 
86 aa  84.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  48.24 
 
 
110 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  51.81 
 
 
87 aa  83.2  1e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  52.44 
 
 
82 aa  82.4  2e-15  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4157  glutaredoxin 3  48.24 
 
 
89 aa  82.4  2e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4197  glutaredoxin 3  48.24 
 
 
89 aa  82.4  2e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4389  glutaredoxin  47.56 
 
 
86 aa  82.4  2e-15  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  48.78 
 
 
84 aa  81.6  3e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  48.78 
 
 
85 aa  80.9  5e-15  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  50 
 
 
90 aa  80.9  5e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2144  glutaredoxin 3  47.06 
 
 
104 aa  80.9  5e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2100  glutaredoxin 3  47.06 
 
 
104 aa  80.9  5e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  48.78 
 
 
84 aa  80.9  6e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  47.5 
 
 
85 aa  80.5  7e-15  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  48.78 
 
 
84 aa  80.5  7e-15  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  53.09 
 
 
84 aa  79.7  1e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  50 
 
 
83 aa  79.7  1e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  50 
 
 
83 aa  79.7  1e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  45.12 
 
 
86 aa  79.7  1e-14  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  50 
 
 
83 aa  79.7  1e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  50 
 
 
83 aa  79.7  1e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  50 
 
 
83 aa  79.7  1e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2122  glutaredoxin GrxC  50 
 
 
85 aa  79  2e-14  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  52.5 
 
 
84 aa  79  2e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  51.85 
 
 
84 aa  79  2e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  49.4 
 
 
83 aa  79.3  2e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  45.24 
 
 
90 aa  78.6  3e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  52.5 
 
 
84 aa  78.2  3e-14  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  48.78 
 
 
83 aa  78.2  4e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  48.78 
 
 
83 aa  78.2  4e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  48.78 
 
 
83 aa  78.2  4e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  50.62 
 
 
84 aa  78.2  4e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  50.62 
 
 
84 aa  78.2  4e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  48.78 
 
 
83 aa  78.2  4e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  50.6 
 
 
83 aa  78.2  4e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  48.78 
 
 
83 aa  78.2  4e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  48.78 
 
 
83 aa  78.2  4e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  48.78 
 
 
83 aa  78.2  4e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  48.78 
 
 
83 aa  78.2  4e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  50.62 
 
 
84 aa  78.2  4e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  48.78 
 
 
83 aa  78.2  4e-14  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  51.22 
 
 
86 aa  77.8  5e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  43.37 
 
 
96 aa  77  7e-14  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  43.37 
 
 
96 aa  77  7e-14  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  50 
 
 
86 aa  77.4  7e-14  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  49.4 
 
 
83 aa  76.3  1e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  45.78 
 
 
85 aa  76.3  1e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  47.56 
 
 
82 aa  75.5  2e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  49.43 
 
 
86 aa  75.5  2e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  45.12 
 
 
84 aa  75.9  2e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  45.68 
 
 
85 aa  75.1  3e-13  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  46.34 
 
 
84 aa  74.7  4e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0186705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>