39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2695 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2695  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  287  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0116766  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2847  hypothetical protein  61.94 
 
 		 134 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18310  hypothetical protein  59.06 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  49.59 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1587  hypothetical protein  62.1 
 
 		 137 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  45.31 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  45.31 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4230  hypothetical protein  48.76 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  45.31 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  44.88 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2073  hypothetical protein  44.44 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2890  hypothetical protein  84.09 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0309406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  40.94 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  40.34 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  38.6 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2531  hypothetical protein  37.17 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2488  hypothetical protein  37.17 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2439  hypothetical protein  36.21 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2647  hypothetical protein  36.21 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2543  hypothetical protein  36.21 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.141618  normal  0.699642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2414  hypothetical protein  35.96 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.922978  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1399  conserved hypothetical protein  35.09 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02185  hypothetical protein  35.09 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1390  hypothetical protein  35.09 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2555  hypothetical protein  34.19 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.580251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2404  hypothetical protein  35.09 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.920448  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3401  hypothetical protein  34.19 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02144  hypothetical protein  35.09 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  36.94 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  41.27 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  41.27 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  40.3 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  39.13 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  31.43 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  32.86 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  32.86 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  32.86 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  30 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  40.91 
 
 		 107 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>