23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1903 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1903  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378219  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2108  hypothetical protein  95.9 
 
 		 195 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3860  hypothetical protein  63.35 
 
 		 193 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1670  type IV pilus assembly PilZ  60.1 
 
 		 194 aa  224  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1606  type IV pilus assembly PilZ  59.04 
 
 		 188 aa  223  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.0962013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1694  type IV pilus assembly PilZ  57.51 
 
 		 194 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3589  type IV pilus assembly PilZ  56.48 
 
 		 194 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.549929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2153  type IV pilus assembly PilZ  55.96 
 
 		 194 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2172  hypothetical protein  52.48 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25420  hypothetical protein  51.5 
 
 		 254 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1808  hypothetical protein  27.22 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1748  hypothetical protein  34.59 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.690123  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02436  hypothetical protein  27.12 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3217  modification methylase HemK  23.91 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1890  hypothetical protein  23.12 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1901  hypothetical protein  23.12 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1844  type IV pilus assembly PilZ  23.96 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.177632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2288  hypothetical protein  23.93 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1811  hypothetical protein  23.31 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0129545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1731  hypothetical protein  23.46 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000442595  normal  0.728518 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1726  hypothetical protein  26.92 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2026  type IV pilus assembly PilZ  31.76 
 
 		 218 aa  41.2  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2256  hypothetical protein  23.31 
 
 		 206 aa  41.2  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>