19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0825 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0825  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  217  5e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00952872 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0842  glucose sorbosone dehydrogenase  87.27 
 
 		 415 aa  102  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  56.14 
 
 		 376 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  52.73 
 
 		 379 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  47.37 
 
 		 387 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  50 
 
 		 377 aa  50.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  50 
 
 		 377 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  49.09 
 
 		 392 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  42.59 
 
 		 382 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  49.15 
 
 		 394 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  48.21 
 
 		 378 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  50 
 
 		 388 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  65.38 
 
 		 407 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  43.64 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0283  glucose sorbosone dehydrogenase  59.26 
 
 		 377 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  60.71 
 
 		 363 aa  40.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  63.64 
 
 		 400 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  63.64 
 
 		 406 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  63.64 
 
 		 400 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>